More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3744 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  56.73 
 
 		 936 aa  1007    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  58.08 
 
 		 935 aa  1032    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 		 951 aa  1932    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  57.81 
 
 		 938 aa  1047    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  55.61 
 
 		 865 aa  933    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  57.06 
 
 		 936 aa  1013    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  62.32 
 
 		 965 aa  1157    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  55.52 
 
 		 867 aa  874    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  56.74 
 
 		 856 aa  907    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  57.53 
 
 		 945 aa  1072    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  56.18 
 
 		 869 aa  905    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  66.85 
 
 		 951 aa  1232    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  55.52 
 
 		 871 aa  847    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  55.15 
 
 		 871 aa  843    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  56.2 
 
 		 865 aa  882    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  56.8 
 
 		 938 aa  1008    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  39.08 
 
 		 918 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  36.96 
 
 		 751 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  33.33 
 
 		 795 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  33.42 
 
 		 796 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  34.38 
 
 		 795 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  34.46 
 
 		 795 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  33.54 
 
 		 796 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.71 
 
 		 796 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  34.46 
 
 		 795 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  34.38 
 
 		 795 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.46 
 
 		 795 aa  365  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  33.82 
 
 		 795 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.84 
 
 		 795 aa  361  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  32.39 
 
 		 799 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.93 
 
 		 796 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  32.43 
 
 		 799 aa  356  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  32.15 
 
 		 799 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  32.43 
 
 		 799 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  33.72 
 
 		 794 aa  351  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  32.19 
 
 		 799 aa  352  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  32.19 
 
 		 799 aa  352  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  32.19 
 
 		 799 aa  351  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  33.81 
 
 		 812 aa  350  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  32.06 
 
 		 799 aa  350  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  32.06 
 
 		 799 aa  349  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  33.46 
 
 		 794 aa  349  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  33.55 
 
 		 795 aa  348  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  33.55 
 
 		 795 aa  348  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  33.92 
 
 		 795 aa  343  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  31.3 
 
 		 770 aa  251  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  32.11 
 
 		 763 aa  225  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  31.5 
 
 		 763 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  30.34 
 
 		 764 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  29.37 
 
 		 781 aa  210  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.75 
 
 		 927 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  31.04 
 
 		 746 aa  205  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  30.66 
 
 		 1045 aa  200  9e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.41 
 
 		 744 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  28.17 
 
 		 771 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  28.7 
 
 		 806 aa  183  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  28.27 
 
 		 760 aa  177  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  27.89 
 
 		 768 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  27.37 
 
 		 924 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  26.81 
 
 		 811 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.61 
 
 		 747 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  27.7 
 
 		 825 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  36.28 
 
 		 918 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  47.17 
 
 		 792 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  36.02 
 
 		 1565 aa  95.1  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  36.33 
 
 		 1150 aa  95.1  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  37.27 
 
 		 3197 aa  92.8  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  42.42 
 
 		 752 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  40.85 
 
 		 735 aa  92  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  31.92 
 
 		 566 aa  92  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  36.53 
 
 		 3197 aa  90.5  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  40.22 
 
 		 528 aa  90.9  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.55 
 
 		 581 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  37.7 
 
 		 685 aa  87.8  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.46 
 
 		 859 aa  87.8  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 		 3295 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  42.86 
 
 		 1027 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  35.71 
 
 		 679 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  40.83 
 
 		 675 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  35.36 
 
 		 551 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  42.01 
 
 		 669 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.51 
 
 		 1095 aa  85.5  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1916 aa  85.1  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  39.29 
 
 		 658 aa  84.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  41.18 
 
 		 940 aa  84.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  41.1 
 
 		 1094 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.8 
 
 		 2554 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.28 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  40.15 
 
 		 1602 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  39.6 
 
 		 1862 aa  83.2  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.52 
 
 		 930 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  36.56 
 
 		 963 aa  82.8  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  39.05 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  36.81 
 
 		 1667 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.22 
 
 		 1158 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.98 
 
 		 1300 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  35.9 
 
 		 623 aa  80.9  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  38.42 
 
 		 1356 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  26.07 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>