82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3939 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 
825 aa  1695    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  42.88 
 
 
771 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  42.46 
 
 
763 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  41.8 
 
 
763 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  42.01 
 
 
764 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  41.79 
 
 
806 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  42.07 
 
 
811 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  39.15 
 
 
746 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  40.08 
 
 
770 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  36.74 
 
 
781 aa  425  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  38.45 
 
 
760 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35.67 
 
 
744 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  36.84 
 
 
1045 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  35.38 
 
 
768 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  36.74 
 
 
747 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  28.16 
 
 
751 aa  227  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  30.19 
 
 
795 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  30.19 
 
 
795 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  29.83 
 
 
796 aa  211  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.12 
 
 
927 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  29.61 
 
 
795 aa  211  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  28.83 
 
 
795 aa  211  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  29.61 
 
 
795 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  29.61 
 
 
795 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  30.61 
 
 
795 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  28.71 
 
 
795 aa  209  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  29.61 
 
 
795 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  29.61 
 
 
795 aa  209  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  27.54 
 
 
924 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  29.97 
 
 
796 aa  208  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  30.46 
 
 
812 aa  207  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  29.83 
 
 
796 aa  205  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  29.79 
 
 
918 aa  204  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  29.58 
 
 
794 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  29.9 
 
 
794 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  29.17 
 
 
799 aa  190  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  29.35 
 
 
795 aa  189  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  29.17 
 
 
799 aa  188  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  29.11 
 
 
796 aa  188  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  28.88 
 
 
799 aa  187  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  29.02 
 
 
799 aa  187  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  29.02 
 
 
799 aa  187  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  28.88 
 
 
799 aa  187  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  29.02 
 
 
799 aa  187  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  29.02 
 
 
799 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  28.78 
 
 
799 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  26.83 
 
 
938 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  26.65 
 
 
865 aa  141  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  25.49 
 
 
856 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  26.66 
 
 
869 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  26.73 
 
 
965 aa  138  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  27.44 
 
 
951 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  25.44 
 
 
936 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  25.4 
 
 
936 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  25.39 
 
 
951 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  25.47 
 
 
935 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  24.66 
 
 
945 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  25.62 
 
 
938 aa  124  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  26.05 
 
 
865 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  26.79 
 
 
871 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  24.84 
 
 
867 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  25.08 
 
 
871 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  28.57 
 
 
1096 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  29.33 
 
 
633 aa  63.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  29.18 
 
 
735 aa  62  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  28.93 
 
 
1028 aa  62  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  29.19 
 
 
666 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  23.68 
 
 
1367 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  32.28 
 
 
666 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  29.89 
 
 
1309 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40744  predicted protein  25.82 
 
 
583 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3357  hypothetical protein  32.12 
 
 
666 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00235574  hitchhiker  0.000266176 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  32.64 
 
 
574 aa  55.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  30.16 
 
 
513 aa  55.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  40.45 
 
 
1076 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  24.22 
 
 
566 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3339  hypothetical protein  29.75 
 
 
620 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.23 
 
 
582 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  32.82 
 
 
566 aa  49.3  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.91 
 
 
1034 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49918  predicted protein  22.49 
 
 
652 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3710  hypothetical protein  31.25 
 
 
747 aa  44.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>