More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1004 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  47.24 
 
 
751 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  100 
 
 
918 aa  1897    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  40.44 
 
 
936 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  40.32 
 
 
936 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  38.99 
 
 
965 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  37.42 
 
 
935 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  39.86 
 
 
856 aa  572  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  37.05 
 
 
945 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  40.17 
 
 
867 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  39.21 
 
 
869 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  37.61 
 
 
951 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  40.27 
 
 
865 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  39.08 
 
 
951 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  36.57 
 
 
938 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  35.7 
 
 
938 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  39.93 
 
 
871 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  38.29 
 
 
865 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  39.08 
 
 
796 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  39.31 
 
 
871 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  38.11 
 
 
795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  38.11 
 
 
795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  38.45 
 
 
796 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  38.56 
 
 
796 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  39.04 
 
 
795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  38.11 
 
 
795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  38.11 
 
 
795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  37.73 
 
 
795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  38.22 
 
 
795 aa  515  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  37.81 
 
 
795 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  38.35 
 
 
795 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  38.41 
 
 
795 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  38.41 
 
 
795 aa  492  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  38.89 
 
 
799 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  36.92 
 
 
794 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  37.29 
 
 
812 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  38.84 
 
 
799 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  36.5 
 
 
794 aa  486  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  38.78 
 
 
799 aa  485  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  39.41 
 
 
796 aa  485  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  38.58 
 
 
799 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  38.58 
 
 
799 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  38.58 
 
 
799 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  38.39 
 
 
799 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  38.45 
 
 
799 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  38.58 
 
 
799 aa  479  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  33.47 
 
 
770 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  33.24 
 
 
764 aa  283  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  33.1 
 
 
763 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  32.96 
 
 
763 aa  278  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  32.22 
 
 
781 aa  258  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.3 
 
 
927 aa  247  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.16 
 
 
1045 aa  239  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  31.09 
 
 
771 aa  238  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  30.82 
 
 
760 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  30.37 
 
 
924 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  30.2 
 
 
768 aa  218  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  28.98 
 
 
811 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.89 
 
 
744 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  31.48 
 
 
746 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  28.75 
 
 
806 aa  213  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  29.79 
 
 
825 aa  204  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.54 
 
 
747 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  31.39 
 
 
566 aa  102  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  31.58 
 
 
513 aa  98.6  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  36.75 
 
 
1565 aa  97.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  39.29 
 
 
1150 aa  96.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  39.66 
 
 
623 aa  94.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.2 
 
 
816 aa  94.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.31 
 
 
942 aa  94  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  37.95 
 
 
944 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  41.86 
 
 
713 aa  91.3  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.25 
 
 
944 aa  91.3  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  39.61 
 
 
944 aa  90.9  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  39.61 
 
 
944 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.06 
 
 
945 aa  90.5  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  39.61 
 
 
944 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  32.73 
 
 
1027 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  37.25 
 
 
948 aa  87.8  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  23.89 
 
 
1367 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.81 
 
 
836 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  33.12 
 
 
666 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  29.74 
 
 
480 aa  83.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.87 
 
 
835 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  47.87 
 
 
818 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  37.13 
 
 
948 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  47.62 
 
 
780 aa  82  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.05 
 
 
940 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 
955 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  30 
 
 
633 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  35.93 
 
 
948 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  32.95 
 
 
1916 aa  79.7  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  49.38 
 
 
2066 aa  79.7  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  30.06 
 
 
666 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  37.18 
 
 
792 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  35.93 
 
 
948 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  48.24 
 
 
840 aa  78.2  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  40.59 
 
 
775 aa  77  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  33.15 
 
 
1057 aa  75.1  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  41.54 
 
 
965 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 
1158 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>