180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  50.07 
 
 
781 aa  700    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  100 
 
 
1045 aa  2134    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  47.43 
 
 
760 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  44.86 
 
 
744 aa  595  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  42.26 
 
 
806 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  47.92 
 
 
747 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  43.91 
 
 
770 aa  572  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  44.7 
 
 
763 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  41.38 
 
 
768 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  44.31 
 
 
763 aa  556  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  43.63 
 
 
764 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  44.18 
 
 
746 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  41.6 
 
 
771 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  37.81 
 
 
811 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  36.84 
 
 
825 aa  419  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  57.23 
 
 
962 aa  344  5e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  55.16 
 
 
1312 aa  315  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.67 
 
 
795 aa  298  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  32.84 
 
 
795 aa  294  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  32.84 
 
 
795 aa  294  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  32.84 
 
 
795 aa  294  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.84 
 
 
795 aa  294  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.99 
 
 
795 aa  293  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  32.32 
 
 
795 aa  293  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  32.94 
 
 
751 aa  292  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  32.64 
 
 
796 aa  288  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  32.01 
 
 
795 aa  288  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  32.64 
 
 
796 aa  287  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.79 
 
 
796 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  32.56 
 
 
794 aa  278  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  32.42 
 
 
794 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  31.16 
 
 
918 aa  273  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  32.03 
 
 
795 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  32.03 
 
 
795 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  31.96 
 
 
799 aa  269  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  31.79 
 
 
812 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  32.01 
 
 
799 aa  268  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  31.85 
 
 
799 aa  267  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  31.85 
 
 
799 aa  267  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  31.7 
 
 
799 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  31.7 
 
 
799 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  31.7 
 
 
799 aa  262  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  32.17 
 
 
795 aa  263  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  31.37 
 
 
799 aa  261  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  31.54 
 
 
799 aa  261  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  31.46 
 
 
796 aa  255  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.81 
 
 
927 aa  249  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  31.61 
 
 
936 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  31.33 
 
 
936 aa  230  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  28.51 
 
 
945 aa  229  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  29.91 
 
 
856 aa  229  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  30.25 
 
 
951 aa  226  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  29.77 
 
 
965 aa  224  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  29.3 
 
 
951 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  28.57 
 
 
869 aa  214  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  28.83 
 
 
935 aa  211  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  28.03 
 
 
938 aa  207  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  26.84 
 
 
924 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  28.93 
 
 
865 aa  205  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  27.24 
 
 
938 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  28.57 
 
 
867 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  28.15 
 
 
865 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  29.07 
 
 
871 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  28.79 
 
 
871 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  33.24 
 
 
600 aa  160  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.76 
 
 
795 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.5 
 
 
706 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.94 
 
 
326 aa  149  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  29.8 
 
 
570 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.76 
 
 
510 aa  141  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.94 
 
 
640 aa  141  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.03 
 
 
871 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.31 
 
 
649 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.89 
 
 
905 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  32.12 
 
 
538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.04 
 
 
543 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  33.24 
 
 
848 aa  131  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  34.26 
 
 
998 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.96 
 
 
619 aa  124  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.56 
 
 
600 aa  124  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.82 
 
 
624 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  28 
 
 
637 aa  122  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.08 
 
 
475 aa  122  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.74 
 
 
769 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  33.7 
 
 
688 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  31.6 
 
 
1452 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.54 
 
 
885 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.5 
 
 
860 aa  115  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.97 
 
 
847 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  31.59 
 
 
688 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.79 
 
 
1412 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.7 
 
 
530 aa  111  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  29.15 
 
 
600 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  31.67 
 
 
589 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.15 
 
 
342 aa  109  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.09 
 
 
1550 aa  108  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.1 
 
 
551 aa  107  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  31.86 
 
 
976 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  29.8 
 
 
1916 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  32.47 
 
 
1037 aa  103  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>