77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3015 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 475 aa  939    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  34.08 
 
 		 1045 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  36.21 
 
 		 962 aa  133  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  35.31 
 
 		 1312 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.23 
 
 		 326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  32.3 
 
 		 640 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  30.71 
 
 		 600 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.15 
 
 		 795 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.3 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.03 
 
 		 600 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.49 
 
 		 749 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  29.83 
 
 		 1550 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  24.87 
 
 		 600 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.79 
 
 		 649 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.3 
 
 		 637 aa  97.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.57 
 
 		 2884 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  33.54 
 
 		 570 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.84 
 
 		 706 aa  93.6  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  30.77 
 
 		 1452 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.28 
 
 		 769 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.01 
 
 		 833 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.34 
 
 		 619 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  32.31 
 
 		 688 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  33.7 
 
 		 554 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.67 
 
 		 871 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.72 
 
 		 624 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.82 
 
 		 885 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.01 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  32.77 
 
 		 688 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.76 
 
 		 860 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  31.85 
 
 		 678 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  31.37 
 
 		 998 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  30.94 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  33.22 
 
 		 1037 aa  78.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  29.15 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  28.47 
 
 		 976 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.57 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  28.93 
 
 		 673 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  35.8 
 
 		 841 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.08 
 
 		 1073 aa  74.7  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.67 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  32.58 
 
 		 609 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  34.91 
 
 		 661 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  33.45 
 
 		 714 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.32 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  34.28 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  26.76 
 
 		 589 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.87 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.56 
 
 		 847 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.24 
 
 		 719 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  29.35 
 
 		 643 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.13 
 
 		 905 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  34.68 
 
 		 667 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.97 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.3 
 
 		 1916 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.93 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.94 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  26.55 
 
 		 848 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.04 
 
 		 1412 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.43 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.83 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.56 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  28.35 
 
 		 1192 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.2 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  34.1 
 
 		 635 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.83 
 
 		 1135 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0893  cell wall binding repeat 2-containing protein  29.8 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  29.14 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1779  hypothetical protein  31.79 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362511  normal  0.842634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.27 
 
 		 684 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7218  hypothetical protein  32.18 
 
 		 283 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  28.57 
 
 		 682 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1359  hypothetical protein  34.18 
 
 		 668 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000437253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2302  hypothetical protein  26.19 
 
 		 272 aa  43.9  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  23.51 
 
 		 605 aa  43.5  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>