83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1937 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
2884 aa  5774    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  54.93 
 
 
1452 aa  602  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  83.07 
 
 
1550 aa  543  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.82 
 
 
706 aa  180  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  34.89 
 
 
600 aa  174  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.87 
 
 
769 aa  169  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  35.2 
 
 
637 aa  166  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  35.28 
 
 
600 aa  164  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.07 
 
 
619 aa  163  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  37.38 
 
 
640 aa  161  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  40.54 
 
 
688 aa  159  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  35.64 
 
 
570 aa  153  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  45.93 
 
 
2122 aa  151  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.44 
 
 
860 aa  149  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.31 
 
 
510 aa  142  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.45 
 
 
326 aa  141  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.54 
 
 
871 aa  140  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.11 
 
 
795 aa  138  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.48 
 
 
624 aa  129  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.42 
 
 
1412 aa  127  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.41 
 
 
885 aa  125  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  31.23 
 
 
538 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  31.61 
 
 
1037 aa  124  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  33.76 
 
 
976 aa  124  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.68 
 
 
649 aa  123  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  34.17 
 
 
554 aa  122  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  31.8 
 
 
1916 aa  122  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.03 
 
 
1312 aa  122  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  32.49 
 
 
998 aa  122  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.27 
 
 
543 aa  119  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  32.42 
 
 
635 aa  119  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.44 
 
 
1073 aa  119  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.12 
 
 
719 aa  118  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  32.23 
 
 
678 aa  117  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.89 
 
 
530 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34 
 
 
600 aa  112  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  30.87 
 
 
661 aa  112  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.54 
 
 
448 aa  112  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  28.75 
 
 
962 aa  112  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.42 
 
 
442 aa  110  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.63 
 
 
847 aa  110  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.1 
 
 
1045 aa  110  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.33 
 
 
464 aa  109  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.83 
 
 
749 aa  109  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.87 
 
 
386 aa  109  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.48 
 
 
905 aa  107  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.41 
 
 
609 aa  106  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  31.61 
 
 
848 aa  105  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  33.71 
 
 
841 aa  104  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29 
 
 
684 aa  103  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.95 
 
 
688 aa  103  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  29.15 
 
 
589 aa  102  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.22 
 
 
635 aa  102  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 
1192 aa  100  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.14 
 
 
656 aa  99.8  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  29.07 
 
 
673 aa  99  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  31.5 
 
 
643 aa  98.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  30.96 
 
 
714 aa  95.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.66 
 
 
475 aa  94  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.79 
 
 
600 aa  94.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.77 
 
 
551 aa  94.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  30.98 
 
 
682 aa  93.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  44.26 
 
 
2192 aa  88.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  26.79 
 
 
627 aa  85.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  29.75 
 
 
667 aa  82.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  29.57 
 
 
663 aa  77.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  33.46 
 
 
297 aa  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.65 
 
 
1059 aa  77  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  31 
 
 
833 aa  75.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.82 
 
 
342 aa  67.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.88 
 
 
1135 aa  66.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  32.52 
 
 
370 aa  54.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0564  hypothetical protein  22.86 
 
 
415 aa  53.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0566  putative lipoprotein  22.08 
 
 
412 aa  52.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0563  hypothetical protein  22.7 
 
 
415 aa  51.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0720  putative lipoprotein  23.13 
 
 
415 aa  51.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0688  putative lipoprotein  23.75 
 
 
415 aa  50.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0668852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0709  putative lipoprotein  22.37 
 
 
416 aa  50.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.411916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0781  putative lipoprotein  21.24 
 
 
415 aa  50.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0548  hypothetical protein  24.18 
 
 
398 aa  49.7  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4650  putative lipoprotein  22.71 
 
 
415 aa  48.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00382445  unclonable  9.97545e-26 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  33.33 
 
 
3474 aa  48.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0459  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.86 
 
 
1070 aa  47  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>