94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6412 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 1192 aa  2344    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  46.67 
 
 		 1236 aa  621  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  50 
 
 		 442 aa  263  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  48.93 
 
 		 847 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1128 aa  219  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  31.09 
 
 		 841 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  42.05 
 
 		 848 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  45.76 
 
 		 905 aa  207  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  41.44 
 
 		 589 aa  206  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  45.69 
 
 		 976 aa  195  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.23 
 
 		 600 aa  195  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.65 
 
 		 1412 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  30.18 
 
 		 727 aa  192  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  44.01 
 
 		 684 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  44.14 
 
 		 554 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  43.77 
 
 		 682 aa  187  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.35 
 
 		 885 aa  185  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.33 
 
 		 871 aa  182  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  41.69 
 
 		 998 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  34.66 
 
 		 683 aa  176  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  42.33 
 
 		 643 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.36 
 
 		 464 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  42.77 
 
 		 1037 aa  174  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.16 
 
 		 624 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  38.75 
 
 		 714 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.88 
 
 		 656 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  39.57 
 
 		 661 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.37 
 
 		 1073 aa  156  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  29.45 
 
 		 612 aa  154  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  36.24 
 
 		 635 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.18 
 
 		 688 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  30.69 
 
 		 577 aa  153  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  30.3 
 
 		 586 aa  152  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  30.44 
 
 		 596 aa  152  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  39.09 
 
 		 673 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.99 
 
 		 640 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  39.05 
 
 		 678 aa  143  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  37.31 
 
 		 609 aa  135  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  33.23 
 
 		 570 aa  135  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.08 
 
 		 574 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.13 
 
 		 448 aa  133  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  31.58 
 
 		 600 aa  126  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.61 
 
 		 326 aa  125  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.8 
 
 		 663 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.17 
 
 		 386 aa  122  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.39 
 
 		 769 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.03 
 
 		 795 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.24 
 
 		 543 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  31.48 
 
 		 637 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.74 
 
 		 649 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  35.84 
 
 		 627 aa  112  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  34.19 
 
 		 688 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.08 
 
 		 706 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  29.32 
 
 		 1550 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.5 
 
 		 510 aa  102  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  30.49 
 
 		 434 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  36.68 
 
 		 635 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  29.63 
 
 		 1452 aa  98.2  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.85 
 
 		 2884 aa  96.3  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.53 
 
 		 619 aa  95.1  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  33.83 
 
 		 841 aa  94.7  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  30.29 
 
 		 531 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  28.1 
 
 		 538 aa  92.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  29.49 
 
 		 600 aa  90.9  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  30.12 
 
 		 1045 aa  90.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 		 860 aa  89.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.22 
 
 		 1312 aa  88.6  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  34.29 
 
 		 667 aa  88.6  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.32 
 
 		 530 aa  87  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  28.29 
 
 		 962 aa  86.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.93 
 
 		 719 aa  84.7  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  32.51 
 
 		 1916 aa  82.4  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  28.62 
 
 		 1626 aa  78.2  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.36 
 
 		 749 aa  72.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.5 
 
 		 600 aa  68.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  29.84 
 
 		 756 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  37.32 
 
 		 833 aa  65.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.9 
 
 		 342 aa  63.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  26.13 
 
 		 2239 aa  60.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  32.11 
 
 		 897 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.8 
 
 		 1135 aa  55.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.83 
 
 		 475 aa  53.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  26.9 
 
 		 772 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1802 aa  53.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.12 
 
 		 551 aa  52.8  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.03 
 
 		 1212 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  28.24 
 
 		 1029 aa  49.3  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.99 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.55 
 
 		 1073 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  26.97 
 
 		 1736 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  33.05 
 
 		 1303 aa  46.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  24.4 
 
 		 1313 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  31.73 
 
 		 1428 aa  45.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  31.43 
 
 		 1424 aa  45.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>