242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3612 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
667 aa  1302    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  48.54 
 
 
635 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  38.5 
 
 
678 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  38 
 
 
661 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.9 
 
 
624 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.14 
 
 
688 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  36.94 
 
 
673 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  41.87 
 
 
609 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  36.25 
 
 
635 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.21 
 
 
663 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  34.87 
 
 
714 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.82 
 
 
656 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  43 
 
 
1073 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.5 
 
 
386 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  37.97 
 
 
627 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  40.55 
 
 
442 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  36.19 
 
 
643 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  38.8 
 
 
1037 aa  145  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  32.79 
 
 
976 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.85 
 
 
684 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.79 
 
 
871 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.63 
 
 
905 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.01 
 
 
847 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  35.51 
 
 
998 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  33.43 
 
 
848 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  38.83 
 
 
841 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.42 
 
 
719 aa  124  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  34.49 
 
 
589 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  30.19 
 
 
640 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.74 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  32.92 
 
 
637 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  32.46 
 
 
538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  33.65 
 
 
1192 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 
1412 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.04 
 
 
1550 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.28 
 
 
464 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  35.66 
 
 
554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.23 
 
 
860 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.74 
 
 
769 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.52 
 
 
619 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.54 
 
 
885 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  28.85 
 
 
600 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  35.25 
 
 
682 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.84 
 
 
1312 aa  108  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.49 
 
 
543 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  26.61 
 
 
570 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.18 
 
 
2884 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  32.73 
 
 
688 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.09 
 
 
706 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.95 
 
 
1045 aa  101  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.86 
 
 
326 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.68 
 
 
530 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.63 
 
 
600 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  29.97 
 
 
962 aa  95.1  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.13 
 
 
448 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.62 
 
 
649 aa  91.3  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  27.37 
 
 
1452 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.55 
 
 
600 aa  85.5  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.79 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  25.78 
 
 
600 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.59 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  28.28 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.33 
 
 
795 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.65 
 
 
430 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.3 
 
 
430 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.75 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  28.82 
 
 
435 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.56 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.56 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.14 
 
 
833 aa  67.4  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.18 
 
 
434 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.14 
 
 
567 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  31.18 
 
 
434 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  29.29 
 
 
434 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  27.37 
 
 
436 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.84 
 
 
1916 aa  65.1  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  36.55 
 
 
1042 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.57 
 
 
434 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  36.3 
 
 
1040 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.86 
 
 
1059 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.32 
 
 
403 aa  62  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  26.52 
 
 
449 aa  62.4  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  27.51 
 
 
428 aa  61.6  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.52 
 
 
427 aa  61.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  35.62 
 
 
1042 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.46 
 
 
749 aa  60.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  35.84 
 
 
297 aa  60.1  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0311  WD40 domain protein beta Propeller  39.5 
 
 
297 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.12 
 
 
427 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  30.57 
 
 
462 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.27 
 
 
450 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  31.09 
 
 
450 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  31.09 
 
 
450 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.72 
 
 
441 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  32.62 
 
 
449 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  31.02 
 
 
444 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  28.95 
 
 
1062 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  28.95 
 
 
1062 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  26.67 
 
 
1062 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  29.05 
 
 
1062 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>