52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3360 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  100 
 
 		 772 aa  1493    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.25 
 
 		 1073 aa  172  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  32.34 
 
 		 490 aa  144  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  38.04 
 
 		 1029 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  32.66 
 
 		 1736 aa  118  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  35.8 
 
 		 897 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.95 
 
 		 1212 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1802 aa  97.4  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  30.18 
 
 		 2239 aa  97.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1193 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  32.89 
 
 		 607 aa  84.3  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  25.23 
 
 		 1626 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.24 
 
 		 1109 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  25.38 
 
 		 756 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  29.05 
 
 		 1303 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  36.21 
 
 		 1035 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.17 
 
 		 726 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  29.61 
 
 		 2886 aa  65.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  43.48 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 1192 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  38.66 
 
 		 616 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  39.42 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  54.24 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  38.71 
 
 		 2117 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.98 
 
 		 1001 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1590  protein of unknown function DUF1555  27 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.793878  normal  0.172335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1567  protein of unknown function DUF1555  27 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  28.36 
 
 		 1236 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  34.11 
 
 		 608 aa  55.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  37.36 
 
 		 2002 aa  54.3  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  27.88 
 
 		 1313 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  38.54 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  36 
 
 		 2082 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  41.24 
 
 		 699 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1321 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  28.22 
 
 		 2690 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  29.47 
 
 		 561 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  33.1 
 
 		 1310 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  39.13 
 
 		 1421 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  34.44 
 
 		 1424 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.15 
 
 		 812 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1231 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  29.93 
 
 		 1428 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  36.52 
 
 		 848 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  37.89 
 
 		 681 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  31.73 
 
 		 514 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0341  hypothetical protein  30.64 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156991  hitchhiker  0.00506023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3457  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  31.62 
 
 		 335 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0967146 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  22.07 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  30.77 
 
 		 484 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  36.56 
 
 		 1426 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 558 aa  44.3  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>