22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3457 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3457  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  100 
 
 		 335 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0967146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3582  hypothetical protein  33.93 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42680  hypothetical protein  33.93 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  23.42 
 
 		 719 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3070  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  30.25 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.722808  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2246  hypothetical protein  31.62 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  36.17 
 
 		 542 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  28.35 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.29 
 
 		 531 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.92 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  26.34 
 
 		 490 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.86 
 
 		 550 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2399  hypothetical protein  29.31 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480883 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  28.87 
 
 		 502 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  31.62 
 
 		 772 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.86 
 
 		 538 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  27.86 
 
 		 538 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  30.19 
 
 		 510 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  36.14 
 
 		 1026 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  34.04 
 
 		 542 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  29.46 
 
 		 418 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  26.79 
 
 		 664 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>