29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2225 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  100 
 
 		 490 aa  960    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  32.08 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.14 
 
 		 616 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  38.39 
 
 		 1231 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  24.36 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 		 726 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 2082 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0718  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  30.67 
 
 		 295 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.481919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.33 
 
 		 1073 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  26.4 
 
 		 586 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 652 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  47.37 
 
 		 558 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  36.61 
 
 		 699 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  26.19 
 
 		 756 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  30.88 
 
 		 663 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  32.85 
 
 		 644 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  27.61 
 
 		 685 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3457  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  27.54 
 
 		 335 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0967146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  31.48 
 
 		 1736 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0634  serine/threonine protein kinase  23.5 
 
 		 695 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.171322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3070  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  30.58 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.722808  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  28.25 
 
 		 1313 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  32.8 
 
 		 1029 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  39.19 
 
 		 1421 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.53 
 
 		 343 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  34.78 
 
 		 681 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  34.74 
 
 		 1303 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.12 
 
 		 2117 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  40.91 
 
 		 2002 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>