60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2160 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1191    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  38.39 
 
 
1736 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.56 
 
 
1212 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  39.78 
 
 
1193 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2154  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.41 
 
 
305 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000044835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2155  hypothetical protein  36.42 
 
 
420 aa  87.8  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0003635  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  31.58 
 
 
2239 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0341  hypothetical protein  34.48 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156991  hitchhiker  0.00506023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  30.36 
 
 
1029 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.84 
 
 
726 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  34.41 
 
 
897 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.55 
 
 
1109 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  35.75 
 
 
772 aa  71.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.14 
 
 
2886 aa  70.5  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  30.5 
 
 
561 aa  70.5  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.51 
 
 
1001 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  37.04 
 
 
644 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.61 
 
 
1073 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  41.28 
 
 
1428 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  40 
 
 
2082 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  27.8 
 
 
1626 aa  65.1  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  33.86 
 
 
756 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  37.29 
 
 
1303 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  39.45 
 
 
1424 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  35.62 
 
 
2002 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  39.78 
 
 
663 aa  60.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  28.71 
 
 
1802 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  33.61 
 
 
608 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.13 
 
 
1035 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  29.09 
 
 
229 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  35.56 
 
 
2690 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  28.77 
 
 
1313 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  23.32 
 
 
229 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3641  hypothetical protein  29.14 
 
 
332 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  38.39 
 
 
616 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  38.94 
 
 
662 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  29.08 
 
 
231 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  35.09 
 
 
514 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  38.2 
 
 
2169 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  25.13 
 
 
231 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  36.17 
 
 
586 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  38.95 
 
 
1231 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  30.83 
 
 
642 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  31.3 
 
 
588 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5864  hypothetical protein  26.04 
 
 
341 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.777367  normal  0.408229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  37.21 
 
 
791 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1567  protein of unknown function DUF1555  30.15 
 
 
592 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1590  protein of unknown function DUF1555  30.15 
 
 
592 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.793878  normal  0.172335 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.81 
 
 
812 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  34.29 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  27.04 
 
 
1321 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  35.42 
 
 
699 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.69 
 
 
2117 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  27.35 
 
 
1236 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  32.18 
 
 
2207 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  23.53 
 
 
231 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  28.86 
 
 
694 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  29.38 
 
 
270 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  27.5 
 
 
2706 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 
1661 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>