101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2066 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  47.91 
 
 		 1303 aa  1123    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  47.33 
 
 		 1201 aa  788    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  44.61 
 
 		 1380 aa  904    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  60.14 
 
 		 1308 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  47.6 
 
 		 1430 aa  882    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  53.6 
 
 		 1601 aa  1060    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  48 
 
 		 1363 aa  904    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  47.31 
 
 		 1299 aa  844    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 1736 aa  3509    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  47.85 
 
 		 1272 aa  901    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  44.3 
 
 		 1363 aa  904    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  46.68 
 
 		 1299 aa  852    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  37.69 
 
 		 1247 aa  635  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  37.24 
 
 		 1248 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  37.39 
 
 		 1973 aa  433  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 		 734 aa  327  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  30.26 
 
 		 897 aa  132  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  43.08 
 
 		 1193 aa  125  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  26.54 
 
 		 840 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  25.8 
 
 		 2239 aa  120  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.67 
 
 		 1073 aa  119  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  38.39 
 
 		 607 aa  115  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  31.45 
 
 		 756 aa  109  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  27.3 
 
 		 2690 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.63 
 
 		 1109 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.49 
 
 		 1212 aa  103  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  32.79 
 
 		 772 aa  103  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1802 aa  99.8  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  27.93 
 
 		 1626 aa  95.5  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  32.37 
 
 		 625 aa  95.5  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  29.21 
 
 		 1029 aa  95.5  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  28.3 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  31.79 
 
 		 708 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.84 
 
 		 726 aa  79.7  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  35.87 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  32.22 
 
 		 631 aa  77.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  33.71 
 
 		 1094 aa  77  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  26.91 
 
 		 798 aa  77  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  27.86 
 
 		 523 aa  77  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  27.24 
 
 		 687 aa  75.9  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  28.44 
 
 		 620 aa  75.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  27.09 
 
 		 625 aa  75.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  28.67 
 
 		 677 aa  75.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 2082 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  29.24 
 
 		 661 aa  74.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  48.91 
 
 		 1035 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  25.86 
 
 		 798 aa  73.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  26.75 
 
 		 779 aa  73.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  26.32 
 
 		 799 aa  72.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  39.42 
 
 		 616 aa  72  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  27.96 
 
 		 676 aa  71.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  31.98 
 
 		 1313 aa  70.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  31 
 
 		 561 aa  70.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1321 aa  70.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  35.09 
 
 		 1428 aa  68.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  37.12 
 
 		 608 aa  68.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  26.5 
 
 		 779 aa  68.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  34.72 
 
 		 1424 aa  67  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  28.94 
 
 		 528 aa  67  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  25.51 
 
 		 872 aa  65.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  27.11 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  40.16 
 
 		 586 aa  63.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  27.86 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0341  hypothetical protein  30.81 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156991  hitchhiker  0.00506023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.27 
 
 		 1001 aa  61.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  32.67 
 
 		 644 aa  60.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  28.66 
 
 		 2117 aa  60.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.39 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  26.99 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  27.89 
 
 		 2886 aa  59.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.71 
 
 		 663 aa  58.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  37.38 
 
 		 812 aa  57.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  31.23 
 
 		 2002 aa  57.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  38.52 
 
 		 514 aa  56.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.35 
 
 		 569 aa  55.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  33.64 
 
 		 685 aa  55.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  28.43 
 
 		 694 aa  54.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  25.79 
 
 		 486 aa  54.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1103  hypothetical protein  39.44 
 
 		 76 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0650197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  31.31 
 
 		 699 aa  54.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  36.54 
 
 		 1310 aa  53.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  23.71 
 
 		 628 aa  52.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  30.29 
 
 		 588 aa  52  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  28.31 
 
 		 229 aa  50.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  34.23 
 
 		 642 aa  50.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  28.48 
 
 		 528 aa  50.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  32.1 
 
 		 2169 aa  49.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  30.17 
 
 		 595 aa  49.3  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  32.64 
 
 		 662 aa  48.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1231 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  24.28 
 
 		 679 aa  47.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  25.83 
 
 		 547 aa  47  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  23.94 
 
 		 496 aa  47  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  31.48 
 
 		 490 aa  47.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  36.13 
 
 		 657 aa  47  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.86 
 
 		 823 aa  47  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  38.46 
 
 		 536 aa  46.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  24.42 
 
 		 512 aa  46.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2225  hypothetical protein  36.31 
 
 		 1396 aa  45.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142194  hitchhiker  0.00588885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 		 1192 aa  45.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>