57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2318 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  100 
 
 
1321 aa  2659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  30.02 
 
 
1083 aa  210  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  26.2 
 
 
1220 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  24.87 
 
 
1147 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  24.08 
 
 
1043 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  24.94 
 
 
876 aa  115  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  31 
 
 
1117 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  24.53 
 
 
1075 aa  109  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  24.12 
 
 
1090 aa  108  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  25.51 
 
 
931 aa  106  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  25.03 
 
 
1084 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  23.89 
 
 
787 aa  89.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  35.05 
 
 
1233 aa  89.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  33.64 
 
 
1736 aa  89.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  25 
 
 
931 aa  88.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  21.31 
 
 
1060 aa  81.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.87 
 
 
1082 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.2 
 
 
1044 aa  78.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.5 
 
 
931 aa  75.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  23.5 
 
 
952 aa  75.5  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.53 
 
 
1060 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.82 
 
 
1078 aa  73.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  32.53 
 
 
1048 aa  72.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.35 
 
 
1063 aa  72  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.65 
 
 
1073 aa  72  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  32.99 
 
 
756 aa  71.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.35 
 
 
983 aa  71.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  35.66 
 
 
1193 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.49 
 
 
608 aa  68.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  31.35 
 
 
772 aa  67.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  30.61 
 
 
1124 aa  65.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.74 
 
 
1041 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  31.1 
 
 
897 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  32.99 
 
 
1802 aa  63.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  22.05 
 
 
1032 aa  62.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.82 
 
 
999 aa  62  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.16 
 
 
1251 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23.37 
 
 
912 aa  58.9  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  42.72 
 
 
694 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  35.59 
 
 
1207 aa  57.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  24.07 
 
 
607 aa  56.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  30.41 
 
 
1054 aa  57  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  24.9 
 
 
1750 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.5 
 
 
1001 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.19 
 
 
1212 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  24.57 
 
 
2239 aa  51.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  26.27 
 
 
1029 aa  50.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  28.57 
 
 
1313 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  27.22 
 
 
1428 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  31.19 
 
 
699 aa  49.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.62 
 
 
1109 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  38.2 
 
 
681 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  31.85 
 
 
1478 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  28.45 
 
 
1192 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.76 
 
 
1021 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.08 
 
 
359 aa  45.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  36 
 
 
592 aa  45.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>