48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0367 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 787 aa  1594    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  27.01 
 
 		 1084 aa  125  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  26.51 
 
 		 1083 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1075 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1048 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1147 aa  95.1  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1090 aa  94  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 931 aa  91.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1321 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1220 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1054 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 999 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1021 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1043 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1060 aa  80.9  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1117 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1044 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1032 aa  78.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1063 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  27.22 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1060 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1082 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.92 
 
 		 652 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 983 aa  68.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.49 
 
 		 1041 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 371 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.27 
 
 		 630 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  24.21 
 
 		 362 aa  59.7  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  25 
 
 		 1750 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  26.46 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  24.91 
 
 		 371 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  56.2  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  26.44 
 
 		 608 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1078 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  23.35 
 
 		 373 aa  53.9  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  32.43 
 
 		 343 aa  51.2  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.97 
 
 		 361 aa  50.8  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.11 
 
 		 694 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  29.81 
 
 		 409 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  25.42 
 
 		 362 aa  48.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  25.51 
 
 		 913 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  24.38 
 
 		 1904 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  24.52 
 
 		 597 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  31.62 
 
 		 365 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  32.07 
 
 		 320 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  24.22 
 
 		 361 aa  45.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  25.93 
 
 		 780 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>