133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1569 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  44.97 
 
 
1021 aa  888    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  42.22 
 
 
1082 aa  805    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  39.33 
 
 
1048 aa  702    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  43.85 
 
 
1043 aa  888    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  44.82 
 
 
1060 aa  926    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  44.91 
 
 
1078 aa  929    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  48.37 
 
 
1044 aa  978    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  45.9 
 
 
1060 aa  949    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  100 
 
 
1063 aa  2191    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  42.35 
 
 
931 aa  779    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  43.89 
 
 
1032 aa  895    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  38.9 
 
 
999 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  38.01 
 
 
1054 aa  598  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.61 
 
 
1041 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  31.38 
 
 
1075 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  32.75 
 
 
1147 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  31.93 
 
 
1084 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  31.1 
 
 
1090 aa  452  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.26 
 
 
983 aa  429  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  27.38 
 
 
952 aa  281  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23.92 
 
 
912 aa  177  9e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.81 
 
 
681 aa  174  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.35 
 
 
630 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.58 
 
 
652 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  31.6 
 
 
1117 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.77 
 
 
694 aa  121  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  21.33 
 
 
1220 aa  118  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  27.67 
 
 
1083 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  26.59 
 
 
1750 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.99 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  25.33 
 
 
787 aa  77.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  26.3 
 
 
608 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  21.35 
 
 
1321 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  24.23 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  23.02 
 
 
1305 aa  69.7  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  21.31 
 
 
931 aa  68.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.41 
 
 
345 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.41 
 
 
345 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.8 
 
 
757 aa  67.4  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  29.03 
 
 
780 aa  67.4  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  27.55 
 
 
362 aa  65.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.02 
 
 
909 aa  65.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.63 
 
 
361 aa  62.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  21.6 
 
 
357 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  22.08 
 
 
942 aa  61.6  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  26.17 
 
 
320 aa  61.2  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  24.66 
 
 
357 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  24.66 
 
 
350 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  24.6 
 
 
347 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  23.02 
 
 
1904 aa  60.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  23.85 
 
 
357 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  23.21 
 
 
931 aa  60.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  22.8 
 
 
370 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  25.22 
 
 
876 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.1 
 
 
371 aa  58.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.03 
 
 
378 aa  58.2  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  22.69 
 
 
357 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  24.07 
 
 
377 aa  56.2  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.82 
 
 
363 aa  55.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  23.79 
 
 
343 aa  55.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  23.77 
 
 
350 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  23.89 
 
 
371 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  29.69 
 
 
373 aa  55.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  23.77 
 
 
357 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  55.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  55.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  55.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  23.66 
 
 
357 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  21.92 
 
 
357 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  27.16 
 
 
361 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  23.92 
 
 
377 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  28.3 
 
 
362 aa  54.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  23.66 
 
 
357 aa  53.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.8 
 
 
385 aa  53.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  23.66 
 
 
357 aa  53.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  26.92 
 
 
371 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  23.67 
 
 
404 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  23.67 
 
 
404 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.2 
 
 
842 aa  53.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  26.95 
 
 
323 aa  53.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  26.79 
 
 
371 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.51 
 
 
367 aa  53.5  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  24 
 
 
367 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.17 
 
 
381 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  24.08 
 
 
363 aa  53.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  24.03 
 
 
357 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  23.26 
 
 
357 aa  52.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  22.22 
 
 
873 aa  52.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  22.79 
 
 
357 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  22.85 
 
 
365 aa  52  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  22.4 
 
 
913 aa  52  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  23.28 
 
 
357 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  23.9 
 
 
382 aa  51.2  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.83 
 
 
359 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  22.69 
 
 
925 aa  50.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  23.67 
 
 
382 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>