117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2905 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
363 aa  748    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  29.26 
 
 
681 aa  96.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.59 
 
 
652 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.76 
 
 
694 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.4 
 
 
630 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.26 
 
 
608 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  24.07 
 
 
1048 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.42 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  24.9 
 
 
1305 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.32 
 
 
597 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  27.97 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  26.12 
 
 
1147 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  27.62 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  27.04 
 
 
1054 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.03 
 
 
909 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  26.39 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  31.11 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  26.67 
 
 
1043 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  30.26 
 
 
1082 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  26.36 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  23.81 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.05 
 
 
999 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  26.45 
 
 
1060 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  25.93 
 
 
1090 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.12 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  30.56 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  31.82 
 
 
1063 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  25.2 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  27.82 
 
 
780 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.94 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.76 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  31.51 
 
 
1032 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.91 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.91 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.42 
 
 
931 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  29.94 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  25.9 
 
 
320 aa  53.1  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.71 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  30 
 
 
321 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  25.29 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.84 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  27.13 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.67 
 
 
1078 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  26.32 
 
 
357 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  25.2 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.08 
 
 
1041 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  25.78 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  25.78 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  25.1 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.98 
 
 
1044 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  31.58 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.58 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.19 
 
 
1021 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  26.37 
 
 
409 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  29.58 
 
 
371 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.54 
 
 
299 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  32.95 
 
 
343 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  28.93 
 
 
1220 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  24.03 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.99 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.99 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.85 
 
 
757 aa  49.3  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.67 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.58 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  28 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.88 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  25.29 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  26.32 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  26.58 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  26.04 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.75 
 
 
1060 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.6 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  24.4 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  26.04 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  23.94 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  23.94 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  26.32 
 
 
357 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.5 
 
 
322 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  22.07 
 
 
912 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.65 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  23.29 
 
 
357 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.46 
 
 
385 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  25.1 
 
 
661 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  27.59 
 
 
361 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  24.41 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.1 
 
 
312 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.04 
 
 
371 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  23.94 
 
 
382 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  26.25 
 
 
373 aa  46.2  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  24.41 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  24.1 
 
 
279 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  26.19 
 
 
911 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  22.53 
 
 
1084 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  29.49 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  25 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  25 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  25.51 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>