134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1158 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  736    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  45.11 
 
 
371 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  45.11 
 
 
371 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  47.25 
 
 
373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  40.76 
 
 
371 aa  305  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.88 
 
 
361 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.82 
 
 
359 aa  272  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.08 
 
 
393 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  44.17 
 
 
362 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  40.9 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.62 
 
 
383 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  39.5 
 
 
377 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.99 
 
 
366 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.53 
 
 
378 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  38.1 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  37.94 
 
 
367 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.5 
 
 
361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  39.95 
 
 
367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  39.94 
 
 
371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  36.76 
 
 
371 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.33 
 
 
381 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  38.42 
 
 
365 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  36.2 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  35.94 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  35.94 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  37.37 
 
 
368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  35.49 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  35.25 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  36.86 
 
 
365 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  35.22 
 
 
385 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  35.33 
 
 
365 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  34.73 
 
 
382 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  34.73 
 
 
382 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  35.69 
 
 
377 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  33.16 
 
 
388 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  33.16 
 
 
388 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  32.54 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  35.92 
 
 
363 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.4 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.39 
 
 
681 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.48 
 
 
608 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  28.61 
 
 
337 aa  106  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  25.95 
 
 
357 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  27.13 
 
 
357 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.95 
 
 
652 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  26.5 
 
 
357 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  33.09 
 
 
343 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  24.85 
 
 
357 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  32.05 
 
 
320 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  26.73 
 
 
357 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  26.73 
 
 
350 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  26.81 
 
 
357 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  25.07 
 
 
357 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  26.81 
 
 
350 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  25.07 
 
 
357 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  27.04 
 
 
357 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  26.42 
 
 
357 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  26.42 
 
 
357 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  24.85 
 
 
357 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  24.34 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  27.03 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.54 
 
 
630 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  26.27 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.51 
 
 
597 aa  92.8  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.36 
 
 
345 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.36 
 
 
345 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  26.7 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  26.7 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  27.2 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  26.7 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  27.46 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  27.46 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  27.46 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  27.46 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.02 
 
 
694 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  28.71 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  24.55 
 
 
1054 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  26.78 
 
 
1147 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.53 
 
 
909 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  26.56 
 
 
1090 aa  69.7  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  25.89 
 
 
1048 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.8 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.8 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  28.9 
 
 
934 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.88 
 
 
1041 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.55 
 
 
1063 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.79 
 
 
999 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.61 
 
 
757 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.58 
 
 
1021 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  28.57 
 
 
906 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.44 
 
 
1044 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  29.58 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.43 
 
 
1060 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  29 
 
 
780 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  23.81 
 
 
1043 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  24.21 
 
 
787 aa  59.7  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.64 
 
 
1082 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  24.17 
 
 
1220 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  24.6 
 
 
1084 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.02 
 
 
1075 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>