147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4900 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  39.25 
 
 		 999 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1048 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  42.67 
 
 		 1043 aa  876    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  52.25 
 
 		 1032 aa  1144    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 1060 aa  2197    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  53.37 
 
 		 1044 aa  1115    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 1082 aa  819    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  44.52 
 
 		 1021 aa  898    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1060 aa  849    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  44.51 
 
 		 1063 aa  931    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  45.99 
 
 		 1078 aa  927    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  43.4 
 
 		 931 aa  772    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  36.66 
 
 		 1054 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  33.3 
 
 		 1075 aa  540  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.78 
 
 		 1041 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  32.15 
 
 		 1147 aa  502  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1090 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  30.21 
 
 		 1084 aa  449  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 983 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  33.41 
 
 		 952 aa  256  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  24.94 
 
 		 912 aa  220  8.999999999999998e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.58 
 
 		 681 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1220 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.25 
 
 		 694 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  22.89 
 
 		 1083 aa  116  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.4 
 
 		 652 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1117 aa  97.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.37 
 
 		 630 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.65 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.65 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 787 aa  80.9  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  24.37 
 
 		 1750 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1321 aa  75.5  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 757 aa  74.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  27.06 
 
 		 597 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  22.64 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  25.38 
 
 		 931 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  26.59 
 
 		 608 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  24.28 
 
 		 931 aa  68.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  28.52 
 
 		 910 aa  68.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  28.9 
 
 		 942 aa  67.8  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  24.93 
 
 		 1904 aa  67.4  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  27.16 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  27.16 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  23.97 
 
 		 367 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  29.8 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  20.24 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.55 
 
 		 842 aa  62  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  26.43 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  20.24 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  25.18 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  25.18 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  24.79 
 
 		 780 aa  61.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 357 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  23.15 
 
 		 357 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  26.75 
 
 		 303 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  21.3 
 
 		 357 aa  61.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  22.78 
 
 		 357 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 357 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  24.62 
 
 		 343 aa  60.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 350 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 357 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  22.19 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  20.85 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  23.03 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  20.85 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.15 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.25 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  22.49 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.33 
 
 		 381 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  24.91 
 
 		 373 aa  57.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  26.5 
 
 		 385 aa  57.4  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  27 
 
 		 382 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  26.5 
 
 		 404 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  26.5 
 
 		 404 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  20.24 
 
 		 357 aa  57  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  21.89 
 
 		 876 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  20.18 
 
 		 350 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  23.71 
 
 		 661 aa  55.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  24.19 
 
 		 370 aa  55.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  24.31 
 
 		 913 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  24.24 
 
 		 371 aa  55.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  23.05 
 
 		 363 aa  54.7  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  24.89 
 
 		 934 aa  53.9  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  20.45 
 
 		 1305 aa  54.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.83 
 
 		 385 aa  53.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  26.46 
 
 		 1298 aa  53.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  21.9 
 
 		 377 aa  52.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  26.05 
 
 		 421 aa  53.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  22.44 
 
 		 347 aa  52.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  24.1 
 
 		 382 aa  52.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  24.68 
 
 		 876 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  24.52 
 
 		 371 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>