110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0910 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  54.52 
 
 		 952 aa  1076    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 983 aa  1998    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  32.36 
 
 		 912 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.14 
 
 		 1041 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  34.8 
 
 		 1147 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 1063 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  33.84 
 
 		 1043 aa  416  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 1044 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1032 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1021 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1060 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1060 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 931 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 1082 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 999 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1090 aa  359  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1075 aa  354  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1078 aa  327  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  29.1 
 
 		 1084 aa  326  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1054 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1048 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1220 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  22.37 
 
 		 681 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  22.48 
 
 		 1083 aa  124  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.3 
 
 		 652 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.7 
 
 		 630 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1117 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  22.53 
 
 		 931 aa  101  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  24.79 
 
 		 931 aa  82.8  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  21.38 
 
 		 876 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.73 
 
 		 694 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1321 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 787 aa  70.1  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  24.21 
 
 		 608 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.56 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.94 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.94 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  26.01 
 
 		 1750 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.24 
 
 		 909 aa  65.1  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  23.65 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.81 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26.76 
 
 		 780 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28 
 
 		 393 aa  57  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  24.83 
 
 		 337 aa  54.7  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  29 
 
 		 925 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 757 aa  53.9  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  24.65 
 
 		 343 aa  53.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  25.23 
 
 		 357 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  27.7 
 
 		 377 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  31.79 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  31.79 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  31.79 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  31.79 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  31.79 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  31.79 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  24.63 
 
 		 1904 aa  51.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  29.52 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  29.52 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  26.15 
 
 		 370 aa  50.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.11 
 
 		 361 aa  50.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  29.25 
 
 		 363 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 357 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 357 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  29.8 
 
 		 361 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  24.54 
 
 		 385 aa  49.7  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  29.52 
 
 		 382 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  25.99 
 
 		 279 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  23.96 
 
 		 357 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.21 
 
 		 366 aa  49.3  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  25.64 
 
 		 357 aa  48.9  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  31.13 
 
 		 361 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  27.1 
 
 		 942 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  25.23 
 
 		 1305 aa  48.5  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  28.28 
 
 		 357 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  28.28 
 
 		 357 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  27.5 
 
 		 876 aa  48.5  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  24.77 
 
 		 357 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  27.6 
 
 		 911 aa  48.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  25.91 
 
 		 913 aa  48.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  26.46 
 
 		 357 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  22.19 
 
 		 362 aa  47.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  22.27 
 
 		 382 aa  47.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  25.36 
 
 		 557 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  23.93 
 
 		 873 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.06 
 
 		 378 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  23.84 
 
 		 388 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  23.84 
 
 		 388 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 350 aa  47  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  25.21 
 
 		 357 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.5 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  25.21 
 
 		 357 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  22.99 
 
 		 934 aa  46.2  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  24.77 
 
 		 357 aa  45.8  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  28.21 
 
 		 409 aa  45.8  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  26.78 
 
 		 347 aa  45.8  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  24.39 
 
 		 698 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>