45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2554 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  100 
 
 		 931 aa  1911    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  91.94 
 
 		 931 aa  1743    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  27.14 
 
 		 1083 aa  168  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1082 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1220 aa  102  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1321 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  21.61 
 
 		 952 aa  98.6  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  24.62 
 
 		 876 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1078 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  23 
 
 		 1084 aa  89  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1090 aa  87.8  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 931 aa  85.5  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1117 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1043 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1147 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1048 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.31 
 
 		 1063 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 983 aa  75.5  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1075 aa  72.4  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1032 aa  72.4  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1044 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1060 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.56 
 
 		 1041 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1021 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  22.82 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 999 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1054 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1060 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.79 
 
 		 909 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.87 
 
 		 694 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.59 
 
 		 630 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 757 aa  52  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  27.59 
 
 		 337 aa  51.6  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.83 
 
 		 652 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.53 
 
 		 345 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.53 
 
 		 345 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 		 1191 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26.23 
 
 		 780 aa  49.3  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 371 aa  49.3  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  27.11 
 
 		 371 aa  48.5  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  25 
 
 		 608 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.61 
 
 		 366 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  23.17 
 
 		 362 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  29.08 
 
 		 906 aa  45.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  27.44 
 
 		 377 aa  44.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>