118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2203 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.8 
 
 
909 aa  676    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  50.62 
 
 
780 aa  695    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 
757 aa  1557    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.1 
 
 
681 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.19 
 
 
652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.24 
 
 
630 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.19 
 
 
1220 aa  94.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  26.9 
 
 
608 aa  88.2  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.15 
 
 
1044 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.07 
 
 
694 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  28.48 
 
 
1117 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.33 
 
 
1041 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  24.75 
 
 
1048 aa  74.3  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.91 
 
 
1060 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.59 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.59 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.59 
 
 
999 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.11 
 
 
1082 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.05 
 
 
1078 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  22.6 
 
 
1075 aa  72.4  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.43 
 
 
931 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  26.56 
 
 
1084 aa  69.7  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25.97 
 
 
1032 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  25.75 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.22 
 
 
597 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.29 
 
 
1021 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  23.08 
 
 
1147 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  22.65 
 
 
1054 aa  67.4  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.8 
 
 
1063 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  24.69 
 
 
1043 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  25.61 
 
 
362 aa  64.3  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  24.59 
 
 
1090 aa  64.3  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.7 
 
 
707 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.32 
 
 
385 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  27.68 
 
 
942 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.88 
 
 
359 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  25.93 
 
 
661 aa  60.8  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  24.8 
 
 
1904 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  21.77 
 
 
934 aa  59.3  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  27.67 
 
 
362 aa  58.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.24 
 
 
361 aa  58.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  25.31 
 
 
363 aa  58.9  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  28.44 
 
 
787 aa  58.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.3 
 
 
371 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  22.42 
 
 
1060 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  22.93 
 
 
925 aa  53.9  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  22.67 
 
 
906 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  34.68 
 
 
1750 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  22.55 
 
 
350 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  24.02 
 
 
337 aa  53.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.78 
 
 
842 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  23.06 
 
 
876 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  26.12 
 
 
320 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.32 
 
 
983 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  26.74 
 
 
931 aa  52  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  21.24 
 
 
357 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  24.8 
 
 
952 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  21.82 
 
 
357 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  27.57 
 
 
403 aa  51.2  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.01 
 
 
371 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  26.98 
 
 
913 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.09 
 
 
366 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  27.5 
 
 
1298 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  22.02 
 
 
373 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  26.39 
 
 
365 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.83 
 
 
342 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  21.87 
 
 
1083 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  22.4 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  22.4 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  22.4 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  22.4 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  22.4 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  22.4 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  22.4 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  22.4 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  21.58 
 
 
897 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.4 
 
 
310 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  25.56 
 
 
367 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  23.39 
 
 
527 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.5 
 
 
381 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  31.41 
 
 
1191 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  21.45 
 
 
370 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.85 
 
 
363 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  20.94 
 
 
357 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  27.27 
 
 
377 aa  48.5  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.81 
 
 
1288 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  20.94 
 
 
350 aa  48.5  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  21.82 
 
 
357 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  23.81 
 
 
368 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  28.69 
 
 
363 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  21.45 
 
 
357 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  21.82 
 
 
357 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  24.07 
 
 
365 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  24.24 
 
 
698 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  26.5 
 
 
369 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  25 
 
 
361 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  25.08 
 
 
341 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  27.37 
 
 
343 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  24.81 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.4 
 
 
310 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>