139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0515 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  100 
 
 
1147 aa  2358    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  41.58 
 
 
1090 aa  870    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  43.75 
 
 
1084 aa  879    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  35.53 
 
 
1043 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.95 
 
 
1041 aa  591  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  35.61 
 
 
1075 aa  572  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  32.28 
 
 
1078 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  33.12 
 
 
1060 aa  505  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  35.72 
 
 
1082 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.7 
 
 
1044 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.15 
 
 
1060 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  33.03 
 
 
1048 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.77 
 
 
1021 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  32.75 
 
 
1063 aa  493  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  34.96 
 
 
931 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  32.06 
 
 
1032 aa  480  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  35.53 
 
 
999 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  33.23 
 
 
1054 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.73 
 
 
983 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  32.01 
 
 
952 aa  357  5e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  28.05 
 
 
1220 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.77 
 
 
681 aa  191  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  24.51 
 
 
912 aa  171  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  23.38 
 
 
1083 aa  138  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  28.19 
 
 
1117 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  24.87 
 
 
1321 aa  118  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.51 
 
 
694 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.59 
 
 
652 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.37 
 
 
630 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  27.54 
 
 
787 aa  95.1  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  21.22 
 
 
1750 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.24 
 
 
608 aa  88.6  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  26.44 
 
 
931 aa  87.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.61 
 
 
345 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.61 
 
 
345 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  26.68 
 
 
931 aa  82  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  22.56 
 
 
876 aa  79  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  28.08 
 
 
337 aa  77.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.04 
 
 
597 aa  74.7  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  26.78 
 
 
362 aa  70.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  23.91 
 
 
357 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.08 
 
 
757 aa  67.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  21.47 
 
 
1904 aa  65.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.02 
 
 
707 aa  65.5  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.12 
 
 
363 aa  65.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  22.3 
 
 
371 aa  64.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  28.32 
 
 
661 aa  64.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  28.12 
 
 
323 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  23.44 
 
 
357 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.4 
 
 
385 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  23.44 
 
 
357 aa  62.4  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  24.75 
 
 
361 aa  62.4  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  23.7 
 
 
350 aa  62  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.35 
 
 
361 aa  61.6  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  27.98 
 
 
911 aa  61.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  22.43 
 
 
357 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  28 
 
 
978 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  23.47 
 
 
842 aa  60.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.55 
 
 
371 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  25.38 
 
 
925 aa  59.7  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  28.04 
 
 
323 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  24.71 
 
 
373 aa  59.7  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  24.82 
 
 
320 aa  59.3  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  26.67 
 
 
873 aa  59.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26.52 
 
 
780 aa  59.3  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  21.52 
 
 
370 aa  58.9  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  21.86 
 
 
357 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  24.09 
 
 
361 aa  58.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.37 
 
 
909 aa  58.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  21.86 
 
 
350 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  23.53 
 
 
698 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  22.3 
 
 
357 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  29.33 
 
 
934 aa  56.2  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  22.94 
 
 
388 aa  56.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  22.94 
 
 
388 aa  56.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  26.99 
 
 
913 aa  56.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  23.64 
 
 
357 aa  55.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  22.85 
 
 
404 aa  55.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  22.85 
 
 
404 aa  55.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  25.09 
 
 
385 aa  55.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  24.11 
 
 
942 aa  55.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.82 
 
 
393 aa  54.7  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  27.31 
 
 
1298 aa  54.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  23.41 
 
 
382 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  23.17 
 
 
382 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  26.58 
 
 
363 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  23.65 
 
 
382 aa  53.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  26.89 
 
 
527 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.06 
 
 
359 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  26.23 
 
 
935 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  26.18 
 
 
906 aa  53.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  28.65 
 
 
319 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  28.48 
 
 
557 aa  52.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  29.21 
 
 
346 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>