146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1572 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  43.49 
 
 		 1032 aa  880    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  45.18 
 
 		 1044 aa  952    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  44.98 
 
 		 1021 aa  922    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  37.48 
 
 		 1048 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  43.67 
 
 		 1043 aa  886    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  40.67 
 
 		 1082 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  45.99 
 
 		 1060 aa  927    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1060 aa  867    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  44.91 
 
 		 1063 aa  929    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  41.42 
 
 		 931 aa  737    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 1078 aa  2227    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 999 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1075 aa  582  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1054 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.9 
 
 		 1041 aa  519  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1147 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1090 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  34.32 
 
 		 1084 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 983 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  27.71 
 
 		 952 aa  290  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.5 
 
 		 681 aa  170  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  24.4 
 
 		 912 aa  155  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  23.97 
 
 		 1083 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.77 
 
 		 652 aa  138  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1220 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.96 
 
 		 630 aa  121  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1117 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.53 
 
 		 694 aa  101  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  27.44 
 
 		 931 aa  95.1  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  26.86 
 
 		 931 aa  94.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  29.27 
 
 		 608 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  26.11 
 
 		 1750 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1321 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 757 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.75 
 
 		 345 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.75 
 
 		 345 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  22.05 
 
 		 876 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  27.78 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.5 
 
 		 909 aa  68.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  23.02 
 
 		 337 aa  67.4  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  25.09 
 
 		 925 aa  62.4  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  24.83 
 
 		 942 aa  61.6  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  23.88 
 
 		 382 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  24.82 
 
 		 365 aa  60.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  21.17 
 
 		 1305 aa  60.1  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  22.89 
 
 		 934 aa  59.7  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  23.13 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  23.13 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.58 
 
 		 842 aa  59.3  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  23.79 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  24.25 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  23.51 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  24.9 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.63 
 
 		 361 aa  57.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.12 
 
 		 359 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  23.49 
 
 		 780 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  24.63 
 
 		 388 aa  57  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  24.63 
 
 		 388 aa  57  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  22.98 
 
 		 357 aa  57  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.77 
 
 		 385 aa  57  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  27.63 
 
 		 362 aa  57  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.78 
 
 		 393 aa  56.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  25.52 
 
 		 404 aa  55.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  25.52 
 
 		 404 aa  55.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  28.51 
 
 		 319 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  24.87 
 
 		 1904 aa  55.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.06 
 
 		 361 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  28.51 
 
 		 346 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.14 
 
 		 381 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  24.54 
 
 		 362 aa  54.7  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  22.98 
 
 		 357 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  25.93 
 
 		 323 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  22.58 
 
 		 357 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  23.88 
 
 		 382 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  23.75 
 
 		 371 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  21.62 
 
 		 350 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  20.52 
 
 		 371 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  25.13 
 
 		 382 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  26.47 
 
 		 303 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  21.09 
 
 		 357 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  21.62 
 
 		 357 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  25.81 
 
 		 409 aa  53.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  24.12 
 
 		 597 aa  53.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  28.39 
 
 		 978 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1191 aa  52.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  22.06 
 
 		 365 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  21.62 
 
 		 357 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  21.24 
 
 		 357 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  23.37 
 
 		 367 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  24.29 
 
 		 488 aa  52.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.67 
 
 		 363 aa  52.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>