199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1688 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  100 
 
 		 597 aa  1145    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  43.11 
 
 		 681 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0521  heme utilization protein  29.14 
 
 		 723 aa  209  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160365  normal  0.0276077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.88 
 
 		 630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  39.22 
 
 		 608 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.68 
 
 		 652 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1220 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  26.47 
 
 		 841 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  26.24 
 
 		 740 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.48 
 
 		 694 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  27.01 
 
 		 698 aa  97.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  21.51 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1060 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2020  hypothetical protein  26.03 
 
 		 344 aa  91.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1021 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1063 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 931 aa  86.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  29.19 
 
 		 661 aa  85.9  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.49 
 
 		 1041 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  22.51 
 
 		 1084 aa  80.9  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.08 
 
 		 1044 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  23.29 
 
 		 363 aa  80.1  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.08 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.08 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33215  hypothetical serine rich protein  23.54 
 
 		 2156 aa  77  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.963879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 371 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  23.3 
 
 		 1305 aa  76.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1032 aa  76.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  22.65 
 
 		 912 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  23.92 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1147 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1026 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  21.78 
 
 		 897 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1060 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.62 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  23.22 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  24.01 
 
 		 931 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.25 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1090 aa  71.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1043 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  24.9 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1140 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1082 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.26 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  21.76 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  21.73 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 983 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 757 aa  68.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.33 
 
 		 909 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  23.31 
 
 		 780 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.48 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.99 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  23.22 
 
 		 1083 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  24.21 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0414  hypothetical protein  23.83 
 
 		 500 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.52263  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  23.6 
 
 		 337 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.32 
 
 		 363 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.95 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0306  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  22.48 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  40.18 
 
 		 1191 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  23.05 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  21.51 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1048 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1754  hypothetical protein  25.51 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  33.09 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 367 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  25.16 
 
 		 329 aa  62  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  21.33 
 
 		 371 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 999 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  20.39 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 2082 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1509  hypothetical protein  25.35 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2469  hypothetical protein  25.21 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.92673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  24.88 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  23.12 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  28.23 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.22 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  21.68 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  23.68 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  23.84 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  20.95 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  26.6 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  26.6 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  26.6 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  22.88 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  22.7 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  23.4 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.75 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>