87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1806 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  100 
 
 
912 aa  1874    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  35.45 
 
 
952 aa  528  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.36 
 
 
983 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.38 
 
 
1060 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.92 
 
 
1063 aa  177  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  23 
 
 
1043 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  23.95 
 
 
1147 aa  168  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.68 
 
 
1082 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.81 
 
 
999 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.4 
 
 
1078 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  23.75 
 
 
1054 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.11 
 
 
931 aa  150  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  26.99 
 
 
1032 aa  147  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  23.11 
 
 
1060 aa  147  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.64 
 
 
1044 aa  141  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  25.46 
 
 
1048 aa  141  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  23.01 
 
 
1084 aa  140  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.7 
 
 
1021 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.42 
 
 
1041 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.18 
 
 
1075 aa  134  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  23.19 
 
 
1220 aa  115  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  28.23 
 
 
1090 aa  110  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.03 
 
 
652 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  24.72 
 
 
681 aa  87.4  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.65 
 
 
597 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.5 
 
 
630 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  29.61 
 
 
1117 aa  68.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  22.88 
 
 
1083 aa  67.8  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  23.1 
 
 
608 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  26.4 
 
 
357 aa  65.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  26.4 
 
 
350 aa  64.7  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  26.4 
 
 
357 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  26 
 
 
357 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  27.7 
 
 
1305 aa  62  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.54 
 
 
694 aa  62.4  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.11 
 
 
361 aa  60.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  23.37 
 
 
1321 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.52 
 
 
393 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  25.68 
 
 
350 aa  57  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  23.93 
 
 
370 aa  56.6  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  30.71 
 
 
557 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  28.93 
 
 
372 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  21.07 
 
 
780 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  24.9 
 
 
357 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.02 
 
 
383 aa  54.7  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.1 
 
 
345 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.1 
 
 
345 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  26 
 
 
357 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  25.22 
 
 
362 aa  53.5  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  25.62 
 
 
371 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  25.91 
 
 
357 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  24.12 
 
 
357 aa  51.6  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 
1191 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.06 
 
 
378 aa  50.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  21.47 
 
 
361 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  22.84 
 
 
373 aa  48.9  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  28.41 
 
 
303 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.46 
 
 
909 aa  48.5  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  24.51 
 
 
347 aa  48.5  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.26 
 
 
371 aa  48.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  22.46 
 
 
361 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  47.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  47.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.81 
 
 
707 aa  47.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.07 
 
 
363 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  26.42 
 
 
327 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  23.78 
 
 
334 aa  47  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  23.78 
 
 
334 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  24.52 
 
 
363 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  20.69 
 
 
320 aa  46.2  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.18 
 
 
757 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.13 
 
 
322 aa  46.2  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  23.5 
 
 
337 aa  46.2  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  23.12 
 
 
357 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  30.11 
 
 
876 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  25.83 
 
 
362 aa  45.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.8 
 
 
359 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  20.52 
 
 
365 aa  45.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  23.12 
 
 
357 aa  45.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  23.12 
 
 
357 aa  45.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  23 
 
 
377 aa  44.3  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  23.94 
 
 
367 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.4 
 
 
381 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>