179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1860 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  57.79 
 
 
925 aa  808    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.77 
 
 
984 aa  721    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  48.53 
 
 
873 aa  719    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  53.36 
 
 
913 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  57.41 
 
 
1121 aa  731    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  53.12 
 
 
1298 aa  784    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  96.09 
 
 
1759 aa  1894    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  56.54 
 
 
911 aa  845    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.41 
 
 
938 aa  791    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  58.56 
 
 
842 aa  857    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  63.73 
 
 
741 aa  816    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.39 
 
 
979 aa  796    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  53.17 
 
 
935 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  54.42 
 
 
966 aa  703    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  93.94 
 
 
1478 aa  1857    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  53.86 
 
 
974 aa  722    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  56.01 
 
 
894 aa  722    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  63.05 
 
 
785 aa  826    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  62.98 
 
 
722 aa  867    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  54.93 
 
 
978 aa  833    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  54.29 
 
 
934 aa  749    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  56.51 
 
 
963 aa  717    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  60.68 
 
 
854 aa  840    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  56.92 
 
 
900 aa  750    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  58.09 
 
 
842 aa  771    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  53.86 
 
 
942 aa  872    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  54.3 
 
 
906 aa  765    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  55.79 
 
 
854 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  57.86 
 
 
973 aa  743    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 
1904 aa  3871    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  65.54 
 
 
919 aa  906    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  45.42 
 
 
836 aa  602  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  84.99 
 
 
1414 aa  603  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  94.96 
 
 
1369 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  94.69 
 
 
1294 aa  596  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.55 
 
 
707 aa  440  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  36.28 
 
 
1288 aa  414  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01542  oligo-xyloglucan specific cellobiohydrolase (Eurofung)  33.53 
 
 
810 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  98.05 
 
 
833 aa  308  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4813  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.18 
 
 
778 aa  258  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.58 
 
 
887 aa  159  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  48.37 
 
 
1853 aa  156  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 
928 aa  155  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  47.47 
 
 
857 aa  150  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  37.26 
 
 
522 aa  149  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.75 
 
 
985 aa  145  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  44 
 
 
1017 aa  129  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  46.1 
 
 
1209 aa  129  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
961 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  38.58 
 
 
671 aa  127  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  32.48 
 
 
949 aa  127  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  47.1 
 
 
1137 aa  126  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  46.05 
 
 
656 aa  125  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  45.45 
 
 
763 aa  124  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  46.05 
 
 
678 aa  123  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  39.52 
 
 
505 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  40.43 
 
 
473 aa  112  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  37.75 
 
 
505 aa  110  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  36.84 
 
 
467 aa  110  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  40.13 
 
 
658 aa  110  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  37.57 
 
 
1546 aa  107  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  32.2 
 
 
1050 aa  104  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.86 
 
 
846 aa  96.3  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  40.67 
 
 
2344 aa  95.9  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  37.09 
 
 
308 aa  94.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  35.53 
 
 
619 aa  86.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  31.65 
 
 
486 aa  84.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 
660 aa  78.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 
1281 aa  78.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  23.95 
 
 
681 aa  77.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 
1224 aa  77.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  29.7 
 
 
1013 aa  76.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  36.24 
 
 
728 aa  75.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  67.69 
 
 
830 aa  72.4  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  25 
 
 
1054 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  25.73 
 
 
1060 aa  70.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.88 
 
 
1060 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  39.84 
 
 
914 aa  68.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  38.1 
 
 
633 aa  67  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.8 
 
 
652 aa  67.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.28 
 
 
630 aa  67  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  21.8 
 
 
1147 aa  66.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  61.9 
 
 
433 aa  65.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  23.35 
 
 
1048 aa  64.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2423  hypothetical protein  27.35 
 
 
998 aa  64.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.59 
 
 
999 aa  64.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.26 
 
 
345 aa  63.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.26 
 
 
345 aa  63.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.72 
 
 
1063 aa  62.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  42.72 
 
 
203 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.14 
 
 
257 aa  61.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.24 
 
 
1044 aa  60.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  46.05 
 
 
916 aa  59.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  31.92 
 
 
456 aa  60.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  26.32 
 
 
1043 aa  59.3  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  26.2 
 
 
320 aa  58.9  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.52 
 
 
694 aa  58.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.16 
 
 
757 aa  58.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  30.3 
 
 
794 aa  57.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  31.36 
 
 
778 aa  57.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>