67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0059 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  100 
 
 		 486 aa  1004    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  29.81 
 
 		 522 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 760 aa  140  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.39 
 
 		 707 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  26.4 
 
 		 644 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  30.42 
 
 		 671 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.38 
 
 		 1853 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  30.77 
 
 		 413 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.83 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.22 
 
 		 985 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.88 
 
 		 887 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.52 
 
 		 857 aa  96.7  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.22 
 
 		 919 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 		 1209 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  33.55 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  33.54 
 
 		 656 aa  86.7  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 		 678 aa  86.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  26.72 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  32.05 
 
 		 763 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  37.69 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  32.47 
 
 		 1298 aa  84  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  27.73 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  25.1 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 		 1121 aa  83.6  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  31.25 
 
 		 1546 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  32.14 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  28.07 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  27.52 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  25.1 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 		 1137 aa  81.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  34.53 
 
 		 2344 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  26.11 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  22.76 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  26.45 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  26.45 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  26.45 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  26.86 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  26.86 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  26.45 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.16 
 
 		 938 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  26.18 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  32.7 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 1013 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  22.98 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  28.24 
 
 		 1017 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  30.99 
 
 		 1050 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  34.35 
 
 		 1294 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.82 
 
 		 833 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  34.09 
 
 		 1369 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  34.35 
 
 		 1414 aa  64.7  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  34.09 
 
 		 1478 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  34.09 
 
 		 1904 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  22.71 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  29.87 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  33.33 
 
 		 1759 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  26.51 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 961 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  30.71 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  22.75 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  36.09 
 
 		 928 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0591  hypothetical protein  24.71 
 
 		 271 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000298116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  30.08 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 1224 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 660 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  32.35 
 
 		 949 aa  46.6  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1806  hypothetical protein  32.76 
 
 		 100 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 728 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>