48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3077 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  100 
 
 
1853 aa  3645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  28.17 
 
 
1546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.02 
 
 
938 aa  172  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.5 
 
 
985 aa  171  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.74 
 
 
887 aa  164  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  52.17 
 
 
857 aa  164  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.6 
 
 
919 aa  162  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  44.02 
 
 
522 aa  155  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  48.39 
 
 
2344 aa  147  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 
1294 aa  139  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 
1369 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  50 
 
 
1414 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  44.03 
 
 
1209 aa  137  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 
1904 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50 
 
 
833 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 
1759 aa  136  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 
1478 aa  137  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  43.31 
 
 
308 aa  137  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1806  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.75 
 
 
2177 aa  136  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  44.03 
 
 
1137 aa  131  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  37.16 
 
 
671 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  43.31 
 
 
1298 aa  131  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  42.68 
 
 
656 aa  129  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  42.41 
 
 
1121 aa  129  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  42.68 
 
 
678 aa  129  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  42.14 
 
 
763 aa  126  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  30 
 
 
486 aa  120  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.26 
 
 
447 aa  112  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  36.97 
 
 
1050 aa  109  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  36.88 
 
 
467 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  41.89 
 
 
728 aa  98.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  34.55 
 
 
505 aa  97.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 
928 aa  95.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  37.74 
 
 
1017 aa  95.5  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  39.19 
 
 
473 aa  92.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  35.37 
 
 
1013 aa  91.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  33.12 
 
 
619 aa  85.5  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0452  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.24 
 
 
257 aa  84  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  32.7 
 
 
505 aa  84  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2951  hypothetical protein  45.79 
 
 
241 aa  84.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.206186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 
961 aa  83.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  35.52 
 
 
949 aa  82.4  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0733  cellulosome anchoring protein cohesin region  35.94 
 
 
230 aa  80.1  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  32.75 
 
 
658 aa  79  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 
1224 aa  62.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 
660 aa  58.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0736  cellulosome anchoring protein, cohesin region  25.75 
 
 
1305 aa  47.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.4308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  28.45 
 
 
1172 aa  46.6  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>