49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1642 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  100 
 
 		 658 aa  1318    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  33.43 
 
 		 1759 aa  187  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  32.96 
 
 		 1414 aa  187  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  33.15 
 
 		 1478 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 		 928 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  36.29 
 
 		 949 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  40.13 
 
 		 1904 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.4 
 
 		 833 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  40.13 
 
 		 1369 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  40.13 
 
 		 1294 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  43.48 
 
 		 1017 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  39.47 
 
 		 1209 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  41.48 
 
 		 763 aa  107  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  41.3 
 
 		 1121 aa  106  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 961 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 		 678 aa  103  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  39.26 
 
 		 1298 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  39.26 
 
 		 656 aa  101  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 		 1137 aa  97.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.5 
 
 		 857 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  33.79 
 
 		 505 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.29 
 
 		 887 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  33.79 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  33.79 
 
 		 308 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.61 
 
 		 938 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  35.81 
 
 		 2344 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.75 
 
 		 1853 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  31.01 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.37 
 
 		 985 aa  77  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  40.22 
 
 		 1170 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.69 
 
 		 919 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  32.09 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  33.33 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  40.23 
 
 		 1216 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 		 728 aa  65.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  31.41 
 
 		 1050 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  33.58 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 660 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  31.07 
 
 		 669 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  29.55 
 
 		 671 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  28.22 
 
 		 1013 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  28.99 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  29.45 
 
 		 1546 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0006  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000384761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 1224 aa  57.4  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.61 
 
 		 1015 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  29.9 
 
 		 1079 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  28.87 
 
 		 994 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>