79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2128 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 857 aa  1733    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  53.88 
 
 		 583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  47.98 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  41.43 
 
 		 591 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  41.52 
 
 		 577 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.81 
 
 		 985 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.43 
 
 		 919 aa  279  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  32.69 
 
 		 815 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.32 
 
 		 469 aa  227  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  31.88 
 
 		 728 aa  211  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.6 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.21 
 
 		 584 aa  188  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.13 
 
 		 558 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.27 
 
 		 938 aa  187  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.92 
 
 		 887 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.17 
 
 		 417 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.14 
 
 		 701 aa  170  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  52.17 
 
 		 1853 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  46.43 
 
 		 522 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 		 315 aa  150  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  48.7 
 
 		 1414 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  48.7 
 
 		 1478 aa  148  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  48.7 
 
 		 1369 aa  148  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  48.7 
 
 		 1759 aa  147  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  49.01 
 
 		 1294 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.7 
 
 		 833 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  48.05 
 
 		 1904 aa  146  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  44.3 
 
 		 308 aa  145  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  43.87 
 
 		 2344 aa  141  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  27.7 
 
 		 355 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  40.53 
 
 		 671 aa  135  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.15 
 
 		 506 aa  131  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  39.62 
 
 		 1546 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  38.61 
 
 		 928 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  37.5 
 
 		 505 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  37.5 
 
 		 505 aa  111  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  32.62 
 
 		 961 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  39.22 
 
 		 1209 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  37.91 
 
 		 763 aa  108  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  37.74 
 
 		 949 aa  107  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 1121 aa  107  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.75 
 
 		 1298 aa  106  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  37.75 
 
 		 656 aa  106  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  37.75 
 
 		 678 aa  106  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  34.72 
 
 		 732 aa  104  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  35.76 
 
 		 619 aa  104  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 1137 aa  104  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  37.41 
 
 		 473 aa  104  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  30.71 
 
 		 694 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  33.53 
 
 		 467 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.38 
 
 		 409 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 		 376 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  40.52 
 
 		 486 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  35.66 
 
 		 1017 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  35.71 
 
 		 1050 aa  95.9  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.13 
 
 		 385 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  37.5 
 
 		 658 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 1013 aa  92  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.45 
 
 		 364 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 660 aa  90.5  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.76 
 
 		 383 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  22.73 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 		 341 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.57 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1030 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 1224 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  24.44 
 
 		 342 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 1937 aa  65.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0623  protein of unknown function DUF291  28.96 
 
 		 2205 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.578825  unclonable  0.00000000542423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  25.42 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  26.95 
 
 		 1069 aa  56.6  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.45 
 
 		 2073 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  33 
 
 		 1672 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1167 aa  52  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  26.12 
 
 		 711 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2423  hypothetical protein  32.58 
 
 		 998 aa  47.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  32.04 
 
 		 443 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>