82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2712 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  100 
 
 		 619 aa  1266    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  67.43 
 
 		 597 aa  626  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  68.68 
 
 		 658 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  68.16 
 
 		 649 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  69.68 
 
 		 580 aa  605  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  63.79 
 
 		 633 aa  586  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  56.22 
 
 		 526 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  57.68 
 
 		 1414 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  53.18 
 
 		 566 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  48.53 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  53.05 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  51.39 
 
 		 660 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  44.51 
 
 		 563 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  46.94 
 
 		 539 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  36.75 
 
 		 2305 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  37.77 
 
 		 542 aa  218  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  34.03 
 
 		 562 aa  211  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.56 
 
 		 2310 aa  210  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  34.15 
 
 		 608 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  31.02 
 
 		 496 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  30.15 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  29.23 
 
 		 614 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  50.68 
 
 		 1121 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  50.68 
 
 		 763 aa  140  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  50.68 
 
 		 1209 aa  140  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  49.66 
 
 		 1298 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 		 1137 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  47.62 
 
 		 678 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  47.62 
 
 		 656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 		 440 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.74 
 
 		 887 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.96 
 
 		 985 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.76 
 
 		 857 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.44 
 
 		 1853 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  39.05 
 
 		 505 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.92 
 
 		 938 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  34.09 
 
 		 928 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  40 
 
 		 1017 aa  97.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  41.67 
 
 		 473 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  39.62 
 
 		 467 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.55 
 
 		 919 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  31.49 
 
 		 522 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  35.53 
 
 		 1478 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  35.53 
 
 		 1759 aa  92  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  35.53 
 
 		 1369 aa  90.9  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  35.53 
 
 		 1294 aa  90.9  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.76 
 
 		 833 aa  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  35.53 
 
 		 1904 aa  90.1  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  26.54 
 
 		 632 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  36.71 
 
 		 505 aa  87  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  24.76 
 
 		 725 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  34.13 
 
 		 949 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 961 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  34.16 
 
 		 1546 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  26.32 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  31.76 
 
 		 2344 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  29.05 
 
 		 308 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  29.73 
 
 		 486 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  23.23 
 
 		 584 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  26.88 
 
 		 671 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  23.03 
 
 		 590 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  24.38 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  33.58 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  28.76 
 
 		 1050 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 1224 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  23.16 
 
 		 863 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  29.65 
 
 		 486 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 728 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  30.28 
 
 		 368 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  21.07 
 
 		 470 aa  47.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  22.22 
 
 		 601 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  25.43 
 
 		 382 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  20.36 
 
 		 358 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  23.26 
 
 		 533 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  24.42 
 
 		 573 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  26.16 
 
 		 651 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  28.87 
 
 		 368 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  26.14 
 
 		 768 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  21.88 
 
 		 869 aa  43.9  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25.89 
 
 		 1115 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>