35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4225 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 632 aa  1278    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  49.92 
 
 		 642 aa  599  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  31.12 
 
 		 542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  26.93 
 
 		 608 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 660 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  28.12 
 
 		 2305 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  28.27 
 
 		 597 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 658 aa  94.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  35.24 
 
 		 480 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  28.11 
 
 		 580 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  26.54 
 
 		 619 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 633 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  26.87 
 
 		 649 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.1 
 
 		 2310 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09166  cellulase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14560)  23.92 
 
 		 412 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110672  normal  0.0495135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  32.78 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 440 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  28.23 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  31.68 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  24.57 
 
 		 1414 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  31.55 
 
 		 584 aa  72  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  23.44 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  27.76 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  21.23 
 
 		 566 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  21.74 
 
 		 551 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  21.81 
 
 		 343 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  25.93 
 
 		 725 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 468 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 		 705 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  19.53 
 
 		 534 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>