58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1257 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  100 
 
 		 1050 aa  2145    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40.37 
 
 		 1853 aa  107  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.25 
 
 		 887 aa  101  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 1013 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.42 
 
 		 985 aa  99.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  30.6 
 
 		 1546 aa  99  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.14 
 
 		 919 aa  97.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.71 
 
 		 857 aa  95.5  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  35.76 
 
 		 308 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.76 
 
 		 938 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  36.54 
 
 		 505 aa  91.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  32.68 
 
 		 522 aa  90.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  32.03 
 
 		 2344 aa  87.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2423  hypothetical protein  32.93 
 
 		 998 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  35.26 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  31.48 
 
 		 671 aa  85.5  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  38.66 
 
 		 1321 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  33.33 
 
 		 1017 aa  81.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  34.46 
 
 		 928 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  31.17 
 
 		 1294 aa  72.8  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  30.77 
 
 		 1478 aa  72.8  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  30.77 
 
 		 1414 aa  72.8  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  33.54 
 
 		 949 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  30.77 
 
 		 1759 aa  72.4  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  30.77 
 
 		 1369 aa  72.4  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.77 
 
 		 833 aa  72  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  29.68 
 
 		 1904 aa  72  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  33.76 
 
 		 1209 aa  72  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 		 1121 aa  71.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 		 961 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  29.31 
 
 		 883 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  25.13 
 
 		 467 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 		 678 aa  67.4  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  32.05 
 
 		 656 aa  66.6  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  30.99 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 		 1137 aa  66.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  31.41 
 
 		 658 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  32.05 
 
 		 1298 aa  64.7  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.05 
 
 		 627 aa  64.3  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  34.59 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  28.76 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  31.85 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.33 
 
 		 927 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.17 
 
 		 1255 aa  55.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 641 aa  55.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.53 
 
 		 1290 aa  53.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 		 642 aa  52  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 		 1224 aa  52  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 1184 aa  50.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  27.2 
 
 		 1414 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 		 660 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  22.54 
 
 		 895 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1241  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  26.13 
 
 		 351 aa  48.9  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00026508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 728 aa  48.5  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 846 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0954  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1354 aa  47.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000910199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.11 
 
 		 1694 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.75 
 
 		 998 aa  46.2  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>