47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1953 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  100 
 
 
614 aa  1218    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  64.23 
 
 
480 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  67.24 
 
 
496 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  38.92 
 
 
542 aa  250  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  40.18 
 
 
562 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  38.76 
 
 
608 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.89 
 
 
2305 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  36.34 
 
 
2310 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  34.53 
 
 
584 aa  189  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  34.23 
 
 
584 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  30.56 
 
 
590 aa  183  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  32.71 
 
 
1414 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  31.4 
 
 
649 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  31.97 
 
 
597 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  31.88 
 
 
660 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 
658 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  30.08 
 
 
619 aa  153  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  30.02 
 
 
566 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  30.13 
 
 
580 aa  147  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  28.71 
 
 
534 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  27.47 
 
 
725 aa  144  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 
633 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  27.63 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  63.27 
 
 
639 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  62.24 
 
 
628 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
563 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  25.27 
 
 
539 aa  107  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  54.32 
 
 
572 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  28.57 
 
 
632 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  30.51 
 
 
642 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  36.47 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 
440 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 
440 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  33.33 
 
 
811 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  27.36 
 
 
2570 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9097  hypothetical protein  37.25 
 
 
3151 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3209  hypothetical protein  26.88 
 
 
1143 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0782308  normal  0.555781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  31.63 
 
 
864 aa  51.6  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.43 
 
 
1186 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  34.67 
 
 
990 aa  47.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  41.89 
 
 
366 aa  47.4  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30195  hypothetical protein, likely cell wall localized and GPI-anchored mucin like  33.87 
 
 
812 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.322783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  24.14 
 
 
365 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  34 
 
 
1029 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  32.45 
 
 
1348 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  37.04 
 
 
491 aa  43.9  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>