63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1089 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 566 aa  1156    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  52.1 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  43.91 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  27.15 
 
 		 1194 aa  86.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  26.14 
 
 		 717 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  25.08 
 
 		 1221 aa  84.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  24.61 
 
 		 703 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  24.59 
 
 		 1004 aa  74.3  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  25.68 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  22.65 
 
 		 651 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  22.64 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  24.03 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  25.15 
 
 		 480 aa  67  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  22.1 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  22.97 
 
 		 505 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  23.16 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  23.08 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  27.78 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  25.32 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  24.16 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  22.82 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  23.89 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  21.43 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.49 
 
 		 673 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  31.3 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  26.79 
 
 		 457 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  23.21 
 
 		 533 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  32.85 
 
 		 630 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  24.79 
 
 		 601 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25.86 
 
 		 573 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 489 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 709 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.7 
 
 		 335 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.69 
 
 		 312 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  21.84 
 
 		 930 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  31.82 
 
 		 638 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1167 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  22.51 
 
 		 1414 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  25.81 
 
 		 451 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  20.65 
 
 		 748 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  20.8 
 
 		 551 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  21.81 
 
 		 462 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  21.94 
 
 		 526 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  21.41 
 
 		 633 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  28.67 
 
 		 332 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  24.66 
 
 		 346 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  24.23 
 
 		 614 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  23.53 
 
 		 1115 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  24.53 
 
 		 580 aa  47.4  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  21.75 
 
 		 608 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4628  hypothetical protein  38 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.217828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  22.04 
 
 		 588 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 365 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  20.55 
 
 		 755 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  22.15 
 
 		 597 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  21.08 
 
 		 359 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 343 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  21.57 
 
 		 2305 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  22.04 
 
 		 335 aa  44.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  21.7 
 
 		 619 aa  45.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  23.05 
 
 		 2310 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  21.6 
 
 		 370 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  19.68 
 
 		 562 aa  43.9  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>