105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1853 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  56.85 
 
 		 914 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  54.37 
 
 		 1266 aa  679    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  53.04 
 
 		 677 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  67.25 
 
 		 820 aa  768    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  58.56 
 
 		 618 aa  667    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  60.73 
 
 		 773 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  58.04 
 
 		 743 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  51.57 
 
 		 672 aa  639    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  61.65 
 
 		 676 aa  777    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 833 aa  1704    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  52.78 
 
 		 787 aa  643    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  59.28 
 
 		 1065 aa  701    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  54.61 
 
 		 746 aa  632  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  55.3 
 
 		 744 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  51.6 
 
 		 1880 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  50.25 
 
 		 662 aa  596  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  50.89 
 
 		 658 aa  585  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  50.92 
 
 		 613 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  52.19 
 
 		 774 aa  568  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  48.58 
 
 		 616 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  55.21 
 
 		 669 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  37.25 
 
 		 848 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  43.03 
 
 		 851 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  44.72 
 
 		 803 aa  329  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  43.18 
 
 		 1082 aa  324  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  99.35 
 
 		 1478 aa  310  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  99.35 
 
 		 1759 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  98.7 
 
 		 1369 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  98.69 
 
 		 1294 aa  308  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  98.7 
 
 		 1414 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  98.05 
 
 		 1904 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  40.05 
 
 		 767 aa  301  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  53.07 
 
 		 240 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  31.22 
 
 		 606 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.96 
 
 		 938 aa  161  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  50.8 
 
 		 1853 aa  157  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  46.71 
 
 		 857 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  45.09 
 
 		 928 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.24 
 
 		 919 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  39.53 
 
 		 522 aa  147  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.72 
 
 		 887 aa  144  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.11 
 
 		 985 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  45.03 
 
 		 1017 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  47.4 
 
 		 1209 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  46.36 
 
 		 1121 aa  129  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  47.68 
 
 		 1137 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  47.02 
 
 		 656 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  47.02 
 
 		 678 aa  126  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  47.68 
 
 		 1298 aa  126  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  46.36 
 
 		 763 aa  124  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  38.95 
 
 		 961 aa  124  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  37.39 
 
 		 671 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  39.18 
 
 		 949 aa  118  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  38.92 
 
 		 505 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  40.29 
 
 		 473 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  37.09 
 
 		 505 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  37.33 
 
 		 467 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  40.67 
 
 		 658 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  37.74 
 
 		 1546 aa  101  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  40.67 
 
 		 2344 aa  98.2  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  34.34 
 
 		 308 aa  91.3  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  35.76 
 
 		 619 aa  87.8  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  30.99 
 
 		 486 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 1013 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 		 1224 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  30.77 
 
 		 1050 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  22.8 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  57.14 
 
 		 830 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  42.67 
 
 		 259 aa  54.3  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  36.13 
 
 		 914 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  53.33 
 
 		 433 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  49.15 
 
 		 202 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  65.12 
 
 		 1034 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  52.08 
 
 		 241 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  38.68 
 
 		 203 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  57.69 
 
 		 1394 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2241  hypothetical protein  23.57 
 
 		 695 aa  51.6  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  36.11 
 
 		 268 aa  51.2  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 		 846 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 		 628 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  49.09 
 
 		 1281 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4084  PT repeat-containing protein  27.66 
 
 		 202 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000901223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  63.46 
 
 		 453 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  37.21 
 
 		 876 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  47.06 
 
 		 489 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0681  hypothetical protein  58.7 
 
 		 309 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.735733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  52.73 
 
 		 675 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  30.77 
 
 		 455 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0280  blue (type 1) copper domain protein  35.37 
 
 		 188 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  53.85 
 
 		 771 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2423  hypothetical protein  29.41 
 
 		 998 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4107  hypothetical protein  36.07 
 
 		 239 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121168  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  52.73 
 
 		 778 aa  45.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  54.55 
 
 		 253 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  54.72 
 
 		 456 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  53.19 
 
 		 329 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 261 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  48.33 
 
 		 449 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4120  hypothetical protein  37.33 
 
 		 153 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>