30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2353 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1385    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2241  hypothetical protein  33.54 
 
 		 695 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  39.75 
 
 		 653 aa  107  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  39.75 
 
 		 460 aa  107  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  26.53 
 
 		 618 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.57 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  26.1 
 
 		 1065 aa  63.9  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  25.19 
 
 		 1266 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  23.03 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  24.7 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  25.31 
 
 		 743 aa  54.7  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  27.98 
 
 		 848 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  30.43 
 
 		 2311 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  23.92 
 
 		 676 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  22.47 
 
 		 820 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  23.48 
 
 		 669 aa  50.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  23.08 
 
 		 773 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1097  hypothetical protein  28.32 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  26.32 
 
 		 744 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2499  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.34 
 
 		 703 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  22.43 
 
 		 672 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.48 
 
 		 3197 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  24.79 
 
 		 803 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  24.25 
 
 		 616 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  22.22 
 
 		 662 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  23.19 
 
 		 851 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  23.28 
 
 		 774 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  25.11 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  25.79 
 
 		 767 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.61 
 
 		 3197 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>