17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2241 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 695 aa  1413    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  33.64 
 
 		 667 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  24.36 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  25.78 
 
 		 820 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  23.62 
 
 		 787 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  23.95 
 
 		 848 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  24.52 
 
 		 743 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  25.26 
 
 		 1266 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.57 
 
 		 833 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  24.71 
 
 		 746 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  27.72 
 
 		 618 aa  48.9  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  22.43 
 
 		 672 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  24.89 
 
 		 1065 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  27.72 
 
 		 669 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  26.07 
 
 		 851 aa  45.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  25.62 
 
 		 653 aa  43.9  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>