144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0417 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  100 
 
 
848 aa  1737    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  42.62 
 
 
820 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  40.92 
 
 
676 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  40.91 
 
 
616 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  37.74 
 
 
914 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  39.52 
 
 
1266 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  40.1 
 
 
773 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  40.16 
 
 
787 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.09 
 
 
833 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  39.29 
 
 
618 aa  382  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  39.4 
 
 
744 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  36.67 
 
 
658 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  39.06 
 
 
677 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  38.49 
 
 
746 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  37.94 
 
 
743 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  37.9 
 
 
1880 aa  363  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  38.26 
 
 
662 aa  362  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  37.31 
 
 
1065 aa  360  7e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  37.36 
 
 
672 aa  359  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  37.3 
 
 
606 aa  343  9e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  37.34 
 
 
613 aa  339  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  40 
 
 
669 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  34.75 
 
 
774 aa  294  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  57.87 
 
 
552 aa  247  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  56.09 
 
 
567 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  56.56 
 
 
560 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  32.76 
 
 
767 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  31.25 
 
 
851 aa  179  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  31.19 
 
 
1082 aa  179  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  29.67 
 
 
803 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  37.45 
 
 
240 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  39.44 
 
 
839 aa  84.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  42.25 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  39.39 
 
 
524 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  43.04 
 
 
707 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  41.18 
 
 
532 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  47.89 
 
 
630 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  41.25 
 
 
477 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  38.57 
 
 
471 aa  65.1  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  42.17 
 
 
425 aa  64.7  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  46.67 
 
 
415 aa  64.3  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  36.84 
 
 
539 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.11 
 
 
831 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.38 
 
 
1051 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  30.47 
 
 
1171 aa  62  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  47.95 
 
 
725 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  45.45 
 
 
435 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  38.89 
 
 
436 aa  61.2  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  39.2 
 
 
951 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  36 
 
 
790 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  42.86 
 
 
861 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  37.78 
 
 
509 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  50 
 
 
308 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  41.89 
 
 
311 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  38.89 
 
 
303 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.95 
 
 
411 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.81 
 
 
469 aa  58.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 
580 aa  58.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
730 aa  58.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 
490 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.08 
 
 
350 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  32.74 
 
 
391 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  39.71 
 
 
535 aa  57.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  39.71 
 
 
484 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  36.78 
 
 
649 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 
591 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2241  hypothetical protein  23.95 
 
 
695 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  36.99 
 
 
295 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  48.48 
 
 
334 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  39.71 
 
 
814 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.28 
 
 
842 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  43.21 
 
 
639 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  42.25 
 
 
722 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  41.79 
 
 
462 aa  56.2  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 
683 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  31.94 
 
 
577 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  34.26 
 
 
584 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  38.67 
 
 
873 aa  55.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
477 aa  55.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  38.81 
 
 
955 aa  55.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 
611 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  42.47 
 
 
554 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  40 
 
 
600 aa  54.3  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  27.98 
 
 
667 aa  54.3  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.48 
 
 
537 aa  54.3  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  42.25 
 
 
621 aa  54.3  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 
566 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  37.5 
 
 
412 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 
736 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  45.16 
 
 
571 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 
619 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 
563 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  40 
 
 
732 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 
590 aa  52  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
1122 aa  52  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  34.94 
 
 
475 aa  52  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.57 
 
 
807 aa  51.6  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  45.76 
 
 
757 aa  51.6  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 
660 aa  51.2  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.36 
 
 
582 aa  50.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>