127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  55.87 
 
 		 743 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  58.32 
 
 		 787 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  53.58 
 
 		 914 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  65.27 
 
 		 677 aa  838    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  54.83 
 
 		 820 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  54.97 
 
 		 618 aa  659    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 1880 aa  3693    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  54.52 
 
 		 773 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  49.05 
 
 		 1065 aa  867    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  65 
 
 		 672 aa  838    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  54.67 
 
 		 676 aa  685    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.6 
 
 		 833 aa  632  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  52.13 
 
 		 662 aa  629  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  47.45 
 
 		 1266 aa  615  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  50.73 
 
 		 613 aa  609  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  51 
 
 		 744 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  52.74 
 
 		 746 aa  595  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  47.65 
 
 		 658 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  55.3 
 
 		 669 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  49.5 
 
 		 774 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  44.87 
 
 		 616 aa  505  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  38.36 
 
 		 848 aa  373  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  40.26 
 
 		 851 aa  345  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  48.67 
 
 		 767 aa  333  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  45.33 
 
 		 1082 aa  330  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  37.38 
 
 		 803 aa  302  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  30.8 
 
 		 606 aa  226  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  45.8 
 
 		 240 aa  214  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.53 
 
 		 831 aa  196  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  32.25 
 
 		 340 aa  184  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  35.91 
 
 		 419 aa  176  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  43.33 
 
 		 285 aa  173  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 266 aa  172  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  39.19 
 
 		 252 aa  170  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  34.9 
 
 		 396 aa  168  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  40.62 
 
 		 727 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  39.64 
 
 		 230 aa  166  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  34.98 
 
 		 266 aa  160  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  34.19 
 
 		 251 aa  153  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  40.57 
 
 		 627 aa  145  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  30.7 
 
 		 258 aa  135  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  34.22 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  32.98 
 
 		 218 aa  119  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  37.42 
 
 		 165 aa  117  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  34.43 
 
 		 233 aa  113  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  34.42 
 
 		 230 aa  111  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  33.04 
 
 		 552 aa  108  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  39.86 
 
 		 161 aa  107  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  33.03 
 
 		 238 aa  100  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  29.07 
 
 		 865 aa  97.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  30.35 
 
 		 280 aa  96.3  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  31.8 
 
 		 571 aa  93.2  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  28.32 
 
 		 2170 aa  91.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  27.73 
 
 		 552 aa  88.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  27.73 
 
 		 552 aa  87.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  25.4 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  36.6 
 
 		 680 aa  75.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  31.67 
 
 		 456 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  25.39 
 
 		 551 aa  70.1  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  32.74 
 
 		 3802 aa  69.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 459 aa  68.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  35.12 
 
 		 1199 aa  68.6  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  33.62 
 
 		 1462 aa  67  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  31.79 
 
 		 277 aa  67.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.22 
 
 		 795 aa  67.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.54 
 
 		 648 aa  67.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  23.58 
 
 		 546 aa  67  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02210  hypothetical protein  43.75 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.563793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  36.56 
 
 		 973 aa  65.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  27.96 
 
 		 250 aa  64.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  33.55 
 
 		 455 aa  64.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.54 
 
 		 455 aa  64.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.21 
 
 		 455 aa  64.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  29.84 
 
 		 1172 aa  64.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  31.32 
 
 		 456 aa  63.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.61 
 
 		 6885 aa  63.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  33.55 
 
 		 458 aa  63.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  36.07 
 
 		 1160 aa  63.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  33.55 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  33.55 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  25.23 
 
 		 1067 aa  62.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  32.14 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  33.33 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  32.89 
 
 		 458 aa  62  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  25.47 
 
 		 245 aa  61.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  32.24 
 
 		 455 aa  61.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 455 aa  60.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  32.24 
 
 		 455 aa  60.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  30.42 
 
 		 1628 aa  58.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  33.14 
 
 		 1795 aa  57.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  34.2 
 
 		 782 aa  57.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  37.6 
 
 		 743 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  32.37 
 
 		 445 aa  55.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0543  Fibronectin type III domain protein  32.93 
 
 		 928 aa  55.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  32.93 
 
 		 656 aa  54.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 455 aa  54.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 692 aa  53.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  41.9 
 
 		 718 aa  53.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  38.13 
 
 		 1363 aa  53.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  33.14 
 
 		 1380 aa  52.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>