288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0258 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  100 
 
 
469 aa  952    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  40.46 
 
 
743 aa  239  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.9 
 
 
821 aa  222  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  38.62 
 
 
778 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.65 
 
 
837 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  35.45 
 
 
784 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.63 
 
 
1679 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.1 
 
 
776 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  35.36 
 
 
911 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  35.5 
 
 
363 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  35.5 
 
 
363 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.5 
 
 
818 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.1 
 
 
1919 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  36.34 
 
 
792 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.75 
 
 
1129 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  37.64 
 
 
717 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  33.61 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  33.76 
 
 
2082 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.06 
 
 
553 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  37.17 
 
 
726 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  36.41 
 
 
835 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  32.2 
 
 
807 aa  173  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.94 
 
 
417 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  37.75 
 
 
714 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  36.88 
 
 
593 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  32.58 
 
 
461 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.42 
 
 
1848 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  30.21 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.61 
 
 
554 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.31 
 
 
706 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  32.97 
 
 
560 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.88 
 
 
561 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  33.24 
 
 
477 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.9 
 
 
563 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  31.59 
 
 
597 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  32.34 
 
 
376 aa  154  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.17 
 
 
556 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  32.87 
 
 
547 aa  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  31.65 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  33.72 
 
 
681 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  32.78 
 
 
558 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  29.56 
 
 
551 aa  146  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  31.48 
 
 
553 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  32.71 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  31.66 
 
 
566 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.57 
 
 
555 aa  140  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  33.14 
 
 
546 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  31.78 
 
 
577 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  32.34 
 
 
443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.68 
 
 
692 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  31.32 
 
 
569 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  31.75 
 
 
1222 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  34.69 
 
 
624 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  33.88 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.78 
 
 
555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.08 
 
 
570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.37 
 
 
900 aa  126  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.95 
 
 
567 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  31.81 
 
 
737 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  33.53 
 
 
558 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.12 
 
 
810 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  27.48 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  36.7 
 
 
554 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.89 
 
 
1126 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  28.65 
 
 
638 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  32.76 
 
 
298 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.15 
 
 
921 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  36.89 
 
 
307 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  24.53 
 
 
575 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  36.1 
 
 
618 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  29.15 
 
 
1207 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.52 
 
 
418 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 
745 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  31.37 
 
 
295 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  27.96 
 
 
328 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.36 
 
 
728 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  30.77 
 
 
295 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.57 
 
 
817 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  33.01 
 
 
558 aa  101  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  26.1 
 
 
341 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.35 
 
 
941 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  26.7 
 
 
1187 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.67 
 
 
1147 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  27.85 
 
 
547 aa  97.1  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  27.11 
 
 
375 aa  96.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  31.82 
 
 
260 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  37.26 
 
 
544 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  27.87 
 
 
371 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  45.54 
 
 
106 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.02 
 
 
787 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  53.25 
 
 
814 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  27.96 
 
 
499 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.77 
 
 
2816 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  35.84 
 
 
332 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.26 
 
 
454 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  29.97 
 
 
602 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  27.3 
 
 
643 aa  86.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.21 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  26.69 
 
 
399 aa  84  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  31.21 
 
 
1312 aa  83.2  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>