163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1157 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  56.16 
 
 		 743 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  53.98 
 
 		 744 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  54.64 
 
 		 914 aa  774    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  100 
 
 		 1266 aa  2565    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  56.59 
 
 		 820 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  51.82 
 
 		 787 aa  652    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  50.48 
 
 		 618 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  55.16 
 
 		 773 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  59.51 
 
 		 676 aa  748    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  54.19 
 
 		 833 aa  678    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  53.64 
 
 		 1065 aa  648    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  56.09 
 
 		 991 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  50.81 
 
 		 677 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  52.27 
 
 		 746 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  47.45 
 
 		 1880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  48.62 
 
 		 672 aa  599  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  48.94 
 
 		 662 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  48.79 
 
 		 613 aa  568  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  52.19 
 
 		 774 aa  561  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  45.96 
 
 		 658 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  55.79 
 
 		 669 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  44.94 
 
 		 616 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  54.48 
 
 		 1288 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  39.52 
 
 		 848 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  40.84 
 
 		 1657 aa  321  7e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  53.23 
 
 		 1247 aa  320  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  40.3 
 
 		 1108 aa  298  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  37.83 
 
 		 1082 aa  286  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  38.42 
 
 		 767 aa  275  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  34.56 
 
 		 851 aa  272  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  49.14 
 
 		 1474 aa  261  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  36.59 
 
 		 803 aa  258  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  47.65 
 
 		 1585 aa  249  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  47.9 
 
 		 1217 aa  249  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  39.5 
 
 		 3793 aa  241  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  46.34 
 
 		 815 aa  230  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  30.67 
 
 		 606 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  43.83 
 
 		 1414 aa  220  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  46.5 
 
 		 1002 aa  217  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  47.41 
 
 		 240 aa  209  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  42.07 
 
 		 1748 aa  209  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  39.4 
 
 		 1160 aa  174  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  37.07 
 
 		 2270 aa  168  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1329 aa  154  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  35.58 
 
 		 1275 aa  142  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.24 
 
 		 1068 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  34.41 
 
 		 1547 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  28.97 
 
 		 5453 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  32.92 
 
 		 2713 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1386 aa  116  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.29 
 
 		 989 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  36.9 
 
 		 1295 aa  105  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.24 
 
 		 1507 aa  101  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  32.6 
 
 		 2262 aa  95.1  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.36 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  32.32 
 
 		 6497 aa  86.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1287 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29.44 
 
 		 2402 aa  84  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  29.65 
 
 		 5544 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  32.08 
 
 		 4429 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  28.83 
 
 		 2278 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  29.97 
 
 		 792 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.15 
 
 		 1607 aa  78.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1313 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1969 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  29.83 
 
 		 627 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1682 aa  71.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25.4 
 
 		 794 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.6 
 
 		 885 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  31.84 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  30.38 
 
 		 658 aa  68.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  28 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  28.95 
 
 		 726 aa  66.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27 
 
 		 752 aa  65.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  25.86 
 
 		 3324 aa  65.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.99 
 
 		 1862 aa  64.3  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  31.82 
 
 		 490 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1163 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  34.96 
 
 		 888 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  25.66 
 
 		 797 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  27.35 
 
 		 1361 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  25.19 
 
 		 667 aa  63.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  28.17 
 
 		 925 aa  62.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.54 
 
 		 1602 aa  62.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.09 
 
 		 1222 aa  62.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1064 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.28 
 
 		 679 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.53 
 
 		 2272 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  28.05 
 
 		 669 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.26 
 
 		 1371 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  26.9 
 
 		 994 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  27.47 
 
 		 978 aa  60.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.94 
 
 		 735 aa  59.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1488 aa  59.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4061  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1351 aa  59.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0111461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1804 aa  58.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  29.06 
 
 		 1356 aa  58.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  29.32 
 
 		 1079 aa  58.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.01 
 
 		 2036 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  30.9 
 
 		 1152 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>