114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0353 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  100 
 
 		 815 aa  1662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  39.82 
 
 		 469 aa  314  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  48.61 
 
 		 1108 aa  284  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.23 
 
 		 584 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 		 728 aa  262  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  36.04 
 
 		 591 aa  260  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  35.58 
 
 		 577 aa  252  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  46.34 
 
 		 1266 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.18 
 
 		 417 aa  230  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.69 
 
 		 532 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  40.91 
 
 		 1288 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.5 
 
 		 857 aa  220  8.999999999999998e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  42.03 
 
 		 991 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.67 
 
 		 558 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 590 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  32.53 
 
 		 583 aa  213  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  36.74 
 
 		 315 aa  195  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.54 
 
 		 506 aa  193  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.23 
 
 		 701 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  43.66 
 
 		 1657 aa  160  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  31.36 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  38.39 
 
 		 341 aa  149  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  39.94 
 
 		 1414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  31.93 
 
 		 1295 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.3 
 
 		 506 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  28.13 
 
 		 506 aa  108  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  34.09 
 
 		 1247 aa  107  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  34.94 
 
 		 1585 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  35.23 
 
 		 1474 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  34.47 
 
 		 694 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  34.38 
 
 		 1217 aa  101  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  40.21 
 
 		 2713 aa  99.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1329 aa  95.5  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  31.07 
 
 		 342 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  40.41 
 
 		 3793 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  29.62 
 
 		 1002 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.34 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.13 
 
 		 1343 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.59 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.27 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  35.9 
 
 		 822 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  34.62 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  30 
 
 		 799 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  22.78 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.45 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  47.24 
 
 		 1275 aa  68.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  30.39 
 
 		 1748 aa  68.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  33.82 
 
 		 1750 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 376 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  38.41 
 
 		 1160 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  36.2 
 
 		 2270 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1547 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1969 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  30.67 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.93 
 
 		 1607 aa  61.6  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  35 
 
 		 1000 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  37.8 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  31.13 
 
 		 792 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  33.56 
 
 		 978 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.74 
 
 		 14944 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  33.04 
 
 		 925 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  30.25 
 
 		 1345 aa  58.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  24.46 
 
 		 711 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  30.68 
 
 		 953 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  34.62 
 
 		 483 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  35.24 
 
 		 401 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  35.97 
 
 		 3563 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  29.11 
 
 		 490 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  34.93 
 
 		 5453 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.81 
 
 		 3197 aa  53.9  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.69 
 
 		 2073 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  33.77 
 
 		 4071 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  26.09 
 
 		 938 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  32.26 
 
 		 2833 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  23.21 
 
 		 794 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.44 
 
 		 2807 aa  51.2  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  35.94 
 
 		 910 aa  50.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  30.26 
 
 		 989 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  35.78 
 
 		 649 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1100 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 		 809 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1488 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  30.86 
 
 		 2454 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  29.75 
 
 		 945 aa  49.3  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  30.86 
 
 		 2367 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  24.6 
 
 		 673 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  29.44 
 
 		 2411 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  26.57 
 
 		 2402 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  25.42 
 
 		 1091 aa  48.5  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  30.11 
 
 		 739 aa  48.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.21 
 
 		 1068 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  32.67 
 
 		 192 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 1222 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  30.86 
 
 		 2421 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4296  carbohydrate-binding family 6 protein  38.78 
 
 		 767 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  35.14 
 
 		 614 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  29.19 
 
 		 627 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  35.23 
 
 		 2042 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.48 
 
 		 1507 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>