38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2276 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 532 aa  1087    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  41.6 
 
 		 728 aa  359  9e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.55 
 
 		 469 aa  336  7e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  39.57 
 
 		 584 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.33 
 
 		 558 aa  259  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 		 591 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  33.59 
 
 		 577 aa  234  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 590 aa  231  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.67 
 
 		 417 aa  230  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  30.69 
 
 		 815 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.87 
 
 		 506 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  32.04 
 
 		 583 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  38.78 
 
 		 355 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.6 
 
 		 857 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  36.52 
 
 		 315 aa  193  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.34 
 
 		 701 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  35.22 
 
 		 341 aa  153  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.9 
 
 		 506 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  28.96 
 
 		 342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  33.51 
 
 		 506 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.13 
 
 		 409 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  37.24 
 
 		 694 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 376 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.46 
 
 		 383 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.11 
 
 		 385 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.05 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  29.35 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  25.17 
 
 		 711 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.75 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  28.82 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  27.78 
 
 		 300 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  27.78 
 
 		 285 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  27.78 
 
 		 285 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  29.92 
 
 		 490 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  21.37 
 
 		 334 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.22 
 
 		 790 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>