71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0413 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  100 
 
 
300 aa  564  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  100 
 
 
285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  98.95 
 
 
285 aa  557  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  45.74 
 
 
415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  44.48 
 
 
407 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  43.77 
 
 
409 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  44.94 
 
 
442 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  37.74 
 
 
900 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  39.12 
 
 
490 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  34.01 
 
 
334 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  36.04 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  29.75 
 
 
519 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  31.14 
 
 
375 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  32.29 
 
 
351 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  27.84 
 
 
519 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 
1231 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  29.59 
 
 
520 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  23.53 
 
 
533 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  32.64 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  32.64 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  30.92 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  31.42 
 
 
314 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  29.59 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  31.86 
 
 
620 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.36 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  27.56 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  27.92 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  28.75 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  29.24 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.05 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  28.63 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  23.55 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  31.58 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  27.03 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  28.14 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  39.17 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  39.02 
 
 
409 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  28.12 
 
 
424 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  25.94 
 
 
558 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  25.1 
 
 
360 aa  62.4  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  26.35 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  26.51 
 
 
367 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
376 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  27.27 
 
 
348 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  27.32 
 
 
880 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.59 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  31.45 
 
 
443 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  39.76 
 
 
380 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.37 
 
 
383 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.78 
 
 
886 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  33.33 
 
 
496 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  32.41 
 
 
649 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  31.25 
 
 
427 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  33.33 
 
 
901 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1017  hypothetical protein  26.52 
 
 
506 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.71 
 
 
385 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 
591 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  34.51 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.29 
 
 
506 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  27.27 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  26.87 
 
 
524 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  35.4 
 
 
351 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  36.54 
 
 
652 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  25.86 
 
 
376 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  35.29 
 
 
577 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  24.29 
 
 
342 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  26.34 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.78 
 
 
532 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  25.74 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.21 
 
 
469 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>