45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2043 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 364 aa  755    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  71.35 
 
 		 385 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  70.25 
 
 		 383 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.22 
 
 		 380 aa  289  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  40.39 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.35 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 590 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.42 
 
 		 584 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.2 
 
 		 469 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 591 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.66 
 
 		 558 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  27.73 
 
 		 577 aa  92.8  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  27.95 
 
 		 583 aa  89.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.05 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.95 
 
 		 857 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.51 
 
 		 506 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.83 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  25.6 
 
 		 711 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  27.8 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  25.53 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  27.59 
 
 		 815 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 		 728 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.33 
 
 		 701 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  23.15 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  24.44 
 
 		 694 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  36.59 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  36.59 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  36.59 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  27.35 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 506 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  24.67 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  23.33 
 
 		 442 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  26.58 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  32.14 
 
 		 900 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  26.32 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 1231 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  23.57 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  31.11 
 
 		 490 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  22.15 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  28 
 
 		 443 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  30.63 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>