30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0629 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 
417 aa  848    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.86 
 
 
469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 
591 aa  236  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.43 
 
 
532 aa  235  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  34.35 
 
 
577 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35.18 
 
 
815 aa  230  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 
728 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  37.35 
 
 
590 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  34.97 
 
 
315 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.23 
 
 
558 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.22 
 
 
701 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  36.89 
 
 
355 aa  186  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  34.87 
 
 
583 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.27 
 
 
584 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.17 
 
 
857 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.12 
 
 
506 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 
341 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 
506 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  28.7 
 
 
342 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  27.89 
 
 
694 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.81 
 
 
506 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.48 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.9 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.51 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.74 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24 
 
 
364 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  29.56 
 
 
313 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  26.28 
 
 
711 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>