50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0016 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 558 aa  1129    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  43.69 
 
 		 584 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  41.45 
 
 		 469 aa  339  9e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.33 
 
 		 532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 728 aa  238  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 591 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  32.14 
 
 		 577 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  30.67 
 
 		 815 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  31.95 
 
 		 583 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 		 590 aa  210  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  36.33 
 
 		 315 aa  200  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  39.42 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.23 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.85 
 
 		 506 aa  187  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.89 
 
 		 857 aa  180  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.17 
 
 		 701 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  37.39 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.63 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  29.63 
 
 		 694 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  26.69 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.74 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.66 
 
 		 364 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.47 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.05 
 
 		 409 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 		 458 aa  88.2  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.87 
 
 		 385 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  31.28 
 
 		 711 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  30.74 
 
 		 313 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  40.24 
 
 		 525 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  44.93 
 
 		 896 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.95 
 
 		 407 aa  51.2  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  36.71 
 
 		 679 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  25.35 
 
 		 1061 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  30.91 
 
 		 997 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  36.67 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  31.13 
 
 		 322 aa  47  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  30.86 
 
 		 749 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  27.36 
 
 		 774 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  34.83 
 
 		 788 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  32.14 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  35.37 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  28.97 
 
 		 496 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  35.96 
 
 		 676 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1162 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  30.84 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.14 
 
 		 334 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  36.67 
 
 		 287 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  40.85 
 
 		 479 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>