48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4005 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  100 
 
 		 322 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  89.44 
 
 		 322 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  51.45 
 
 		 314 aa  331  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  56.88 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  48.43 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  48.43 
 
 		 314 aa  321  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  49.84 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  49.03 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  49.03 
 
 		 299 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  48.64 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  37.11 
 
 		 880 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.54 
 
 		 886 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  29.18 
 
 		 558 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  27.56 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  27.56 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  27.56 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  26.91 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  28.3 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  29.38 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  28.57 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  30.05 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  27.68 
 
 		 426 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  24.16 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  26.48 
 
 		 620 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  35.92 
 
 		 652 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.12 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 1231 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  23.27 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  30.83 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  26.61 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  24.18 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  25.85 
 
 		 519 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.55 
 
 		 519 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  25.1 
 
 		 407 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  25.84 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  25.32 
 
 		 442 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  26.06 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  26.17 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  23.62 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.13 
 
 		 558 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  26.34 
 
 		 496 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  26.53 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  26.6 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  28.07 
 
 		 417 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  24.88 
 
 		 520 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  21.62 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  20.87 
 
 		 900 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>